可以将基因表达的调控与分子生理学和功能基因组学的特定方面联系起来。整合分析将RNA-seq数据作为主要基因表达读数与其他基因组实验进行比较，越来越普遍。以下，我们讨论这类分析所面临的一些额外挑战。一、DNA sequencing DNA序列 RNA和DNA测序的结合可以用于多种目的，例如单核苷酸多态性（SNP）的发现、RNA编辑分析或表达量性状
由于m5C甲基化修饰发生在C位点上,可以利用RNA-BiS-seq 技术从单碱基分辨率水平,在全转录组范围内检测检测m5C甲基化修饰的目的。本期小编分享4篇易基因客户合作的高分m5C项目文章,涉及神经退行性疾病、胃癌进展、结直肠癌发生发展、细胞RNA的m5C修饰编程,分别见刊《Molecular Cell》(IF14.5/Q1)、《Journal of Experimen...
目的：确定lncRNA 5’和3’末端序列，进而获得lncRNA的全长信息。原理：在cDNA合成或第二链cDNA合成的过程中末端序列外侧引入接头序列，通过接头引物和基因特异性引物进行PCR扩增，PCR产物经克隆测序获得末端序列信息。2、RNA免疫沉淀 目的：IP是研究RNA蛋白相互作用的重要手段，利用RIP可以研究在体内蛋白是否与lncRNA发...
他们利用 CRISPR 技术对目的 lncRNA 的 promoter 进行了 allele-specific 的切除,然后进行了 allele-specific 的 RNA-seq,检测 target lncRNA 与附近基因的 RNA 水平。 Allele-specific RNA-seq 通过设计 allele-specific oligo,将目的区域附近 1Mb 的 RNAs 区分为两个 allele 来源的 RNA,再进行 RNA-seq。 以l...
RNAi是其中一种有效工具，通过降低特定基因的mRNA表达水平，达到抑制对应蛋白表达的目的。
客户在线下单——订单/实验材料确认——载体构建及转染——获取细胞裂解液——制备磁珠——RNA结合蛋白免疫沉淀——RNA纯化——结果分析（可选RT-qPCR、RIP-Chip、RIP-Seq）——出具实验报告 服务内容及说明 服务内容及说明 适用范围 1、使用目的蛋白寻找验证RNA（蛋白/RNA互作）。2、使用目的lncRNA寻找验证miRNA（...
题目:对DEseq2差异分析得到的差异基因进行GO富集。 目的:旨在对基因和蛋白质功能进行限定和描述的。 内容:1. 下载GO注释背景文件,准备好需要富集的基因列表。 2. ...
此外,根据体外研究的最新发现(Deroyer等人,2019),软骨细胞被报告为调节过程增殖和转分化为“软骨肌成纤维细胞”。 随着OA的发展,处于同一病态组织中的处于不同病理阶段的细胞将会出现,在疾病的发展中起着独特的作用。 因此,通过scRNA-seq分析鉴定不同病理阶段细胞簇的研究工作将有助于更好地了解OA的病因和进展。
m6A抗体富集这部分的protocol,请参考m6A权威,m6A-seq的发明人以色列特拉维夫大学医学院的Gideon Rechavi教授发表在Nature Protocols(Pubmed id:23288318)的文章。这里面会有非常详细的步骤教你如何做m6A抗体去IP带有甲基化修饰的RNA。到时候注意打断长度为200-300nt即可,打断需要做几次条件实验。也就是说除了打断长度转换...