结合RNA-seq数据,揭示了DNA甲基化水平降低与基因表达下调之间的联系,为理解AtSAMS调控花器官发育的分子机制提供了重要线索。 RNA-seq:全面分析了SAMOE植物与WT植物的转录组差异,鉴定出大量差异表达基因(DEGs),揭示了SAMOE植物中基因表达的整体下调趋势。通过分析ABCE基因的表达变化,证实了SAMOE植物中这些关键基因的表达模...
结合RNA-seq数据,揭示了DNA甲基化水平降低与基因表达下调之间的联系,为理解AtSAMS调控花器官发育的分子机制提供了重要线索。 RNA-seq:全面分析了SAMOE植物与WT植物的转录组差异,鉴定出大量差异表达基因(DEGs),揭示了SAMOE植物中基因表达的整体下调趋势。通过分析ABCE基因的表达变化,证实了SAMOE植物中这些关键基因的表达模...
结合RNA-seq数据,揭示了DNA甲基化水平降低与基因表达下调之间的联系,为理解AtSAMS调控花器官发育的分子机制提供了重要线索。 RNA-seq:全面分析了SAMOE植物与WT植物的转录组差异,鉴定出大量差异表达基因(DEGs),揭示了SAMOE植物中基因表达的整体下调趋势。通过分析ABCE基因的表达变化,证实了SAMOE植物中这些关键基因的表达模...
平台:WGBS、RNA-seq等 研究摘要: 本研究通过全基因组亚硫酸盐测序(WGBS-seq)比较了两种处理下的叶片:第12节点的非结果节叶(Nonfruiting-Node Leaves,NFNL)和坐果叶(leaves of fruit setting,FNL)。在这两种处理中,其他节的雌性花均去除。研究结果揭示了大量差异甲基化基因在光合作用和碳水化合物代谢过程中富集。...
平台:WGBS、RNA-seq等 研究摘要: 本研究通过全基因组亚硫酸盐测序(WGBS-seq)比较了两种处理下的叶片:第12节点的非结果节叶(Nonfruiting-Node Leaves,NFNL)和坐果叶(leaves of fruit setting,FNL)。在这两种处理中,其他节的雌性花均去除。研究结果揭示了大量差异甲基化基因在光合作用和碳水化合物代谢过程中富集。
B. RNA-Seq结果中的RT-qPCR验证。 研究小结 本研究首次在松材线虫(PWN)全基因组范围内绘制了DNA甲基化水平的分布情况,证实了线虫在四个发育阶段中均存在DNA甲基化。在扩散性JIII阶段与繁殖性阶段之间,甲基化存在显著差异,表明DNA甲基化可能在JIII阶段抗不利环境条件中发挥潜在作用。研究还支持DNA甲基化在JIII形成...
平台:WGBS、RNA-seq等 研究摘要: 本研究通过全基因组亚硫酸盐测序(WGBS-seq)比较了两种处理下的叶片:第12节点的非结果节叶(Nonfruiting-Node Leaves,NFNL)和坐果叶(leaves of fruit setting,FNL)。在这两种处理中,其他节的雌性花均去除。研究结果揭示了大量差异甲基化基因在光合作用和碳水化合物代谢过程中富集。
绿色框表示该基因被DMR修饰。热图显示了RNA-seq中NFNL和FNL中差异表达基因(DEG)表达水平。Log2(FNL/NFNL)代表基因倍数变化,其中FNL/NFNL是指FPKM reads比率。 图4:DNA甲基化富集与NFNLs和FNLs之间库源调控相关基因表达水平之间的相关性。 左侧和右侧的纵坐标分别表示CHH背景下的DNA甲基化水平和NFNL和FNL之间的...
选定DNA片段的DNA甲基化验证。RNA-Seq结果中的RT-qPCR验证。 研究小结 本研究首次在松材线虫(PWN)全基因组范围内绘制了DNA甲基化水平的分布情况,证实了线虫在四个发育阶段中均存在DNA甲基化。在扩散性JIII阶段与繁殖性阶段之间,甲基化存在显著差异,表明DNA甲基化可能在JIII阶段抗不利环境条件中发挥潜在作用。研究还...
该研究通过对小鼠睾丸组织的全基因组重亚硫酸盐测序(Whole gene bisulfite sequencing,WGBS)与对应的转录组测序(RNA-seq)联合分析,鉴定出与类固醇生成和精子发生过程相关的关键基因和通路,揭示了PM2.5导致男性生殖障碍的潜在DNA甲基化调控...