tar -zxvf vtstscripts.tgz 进入文件,给予权限 cd vtstscripts-1034 chmod+x * 复制需要用的文件脚本到和prohgram并列目录的bin文件中 注意Vasp.pm一定要复制过去,这里需要的命令是nebmake.pl,所以只复制这两个命令 cp Vasp.pm nebmake.pl ../../bin 出现错误请在bin中查找是否给予脚本权限,使用chmod +x 脚...
优化算法若想使用vtst的,需要如上设置IBRION=3,POTIM=0,IOPT设置见上图。若使用vasp自带的优化器,可以使用IBRION=1或者3,不要取2;POTIM取合适的值(0.01-0.5范围内去尝试)。 这样就可以提交NEB任务了。 4. 后处理 计算过程中,可以用nebef.pl命令(不带参数)查看计算收敛情况。 输出中,第二列即为最大受力(fo...
CI-NEB过渡态计算步骤,练习一:O在Au(111)上的迁移 我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优化后结构(两个CONTCAR)的相似程度(每个对应原子的初末态距离的平方...
各位老师好，我在用VASP使用VTST进行过渡态优化时，终端输出如下时，计算自动停止。我查询了VTST的版本为...
4. 把第二步下载的VTSTcode的所有内容拷贝到src/文件夹里,覆盖 5. 找到src/文件夹里面的.objects文件...
VASP一般都会用Intel的mpiifort和mkl来编译,但某些服务器未配置intel的编译器或者特别情况下需使用gnu编译器。VTST是一款过渡态搜索工具,配合VASP使用。 VTST和VASP准备工作 wgethttp://theory.cm.utexas.edu/code/vtstcode-180.tgz wgethttp://theory.cm.utexas.edu/code/vtstscripts.tgz ...
VTST是VASP的过渡态工具，下载地址：http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/index.html VASP及VTST安装均无需root权限，普通用户在自己的目录下也可以安装使用。VASP.5.4.1编译安装：1.解压缩VASP源码包：tar xvf vasp.5.4.1.tar.bz2，解压缩后的目录为vasp.5.4.1。2.进入vasp.5.4.1目录：cd vasp.5...
VASP5.3.5 并行版本+VTST从头编译教程(完整版) 话不多说,直接上教程~~~ 一.环境包 系统:Ubuntu14.04 1.以下软件需要自行单独安装 sudo apt-get install build-essential sudo apt-get install gcc-multilib sudo apt-get install libstdc++5 sudo apt-get install openjdk-6-jre-headless...
我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优化后结构(两个CONTCAR)的相似程度(每个对应原子的初末...
vaspvtstNEB初学者⼊门 NEB 初学者⼊门 Compiled by jbwang, NTU ⼀. NEB 运⾏结果 在机器上已编译好vtstcode，以lscs-6th H 在Ni(001)表⾯扩散过渡态寻找为例，说明vasp neb的计算结果。1)输⼊ INCAR，KPOINTS，POTCAR在上层⽬录 INCAR：SPRING=-5 IMAGES=4 POTIM=0.1 IBRION=2 这样⾃动...