详情请进:http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts.html 后面所有后缀名为pl的脚本都来自这里。 计算步骤 1. 初末态结构优化 建立两个文件夹ini(初态的意思),fin(末态),每个文件夹放入vasp计算必备的四个文件(INCAR,POSCAR,KPOINTS,POTCAR),其中的两个POSCAR对应未优化的初末态。确保两个文件夹里面除P...
我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优化后结构(两个CONTCAR)的相似程度(每个对应原子的初末...
tar -zxvf vtstscripts.tgz 进入文件,给予权限 cd vtstscripts-1034 chmod+x * 复制需要用的文件脚本到和prohgram并列目录的bin文件中 注意Vasp.pm一定要复制过去,这里需要的命令是nebmake.pl,所以只复制这两个命令 cp Vasp.pm nebmake.pl ../../bin 出现错误请在bin中查找是否给予脚本权限,使用chmod +x 脚...
过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG为合理的值即可,在前期试算过程中设置的值为0.02 eV/Å; NEB相关的关键词含义: LCLIMB=.TRUE. #通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3 #specify that VASP does molecular dynamics; P...
在VASP-vtst计算平台中,NEB优化算法通过特定的参数设置(如IOPT参数)实现。vtst脚本包为用户提供了Perl语言编写的工具,例如dist.pl、nebmake.pl等,用于辅助NEB计算的各个步骤,包括结构优化、插点生成等。计算过程分为以下几个步骤:1. 结构优化:分别对初始态和最终态进行结构优化,确保两个优化后的...
我在并行超算平台编译好了 VASP-vtst,计算频率等任务均能正常完成,但在Dimer法寻找过渡态时,无法正常...
安装VASP中的VTST插件需要一系列步骤,包括确认系统环境和VASP版本、下载VTST软件包、解压、配置接口以及编译安装。以下是详细的步骤说明: 确认系统环境和已安装的VASP版本: 确保你的系统环境(如Ubuntu 22.04)和已安装的VASP版本(如VASP 6.3.2)与VTST兼容。 下载VTST软件包: 前往VTST的官方网站或可信的软件仓库下载...
1.http://henkelmanlab.org/vtsttool ... vtst-code-into-vasp 2.http://hmli.ustc.edu.cn/doc...
将解压后的 vasp.5.4.4 文件夹移动到 home 文件夹中 解压vtstcode 安装包 tar –xvzf vtstcode.tar.gz 生成vtstcode-178 文件夹 设置VTST 将vtstcode-178 文件夹目录下所有文件复制到 /home/vasp.5.4.4/src/ 中(替换 chain.F ) 打开并修改 src 文件夹中的 main.F ,将 ...
VTST是VASP的过渡态工具,下载地址:http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/index.html VASP及VTST安装均无需root权限,普通用户在自己的目录下也可以安装使用。VASP.5.4.1编译安装:1.解压缩VASP源码包:tar xvf vasp.5.4.1.tar.bz2,解压缩后的目录为vasp.5.4.1。2.进入vasp.5.4.1目录:cd vasp.5...