VASP.5.4.1+VTST编译安装：步骤基本和 VASP编译安装步骤一致。在上述第3步和第4步之间加入如下操作：设置VTST：wget http://theory.cm.utexas.edu/code/vtstcode.tgztar xvf vtstcode.tgz下载：解压缩：之后会生成vtstcode-171目录，此目录内包含以下文件： bbm.Fbdr_changesbfgs.Fcg.Fchain.Fdimer.Fdynamic...
步骤基本和 VASP编译安装步骤一致。 在上述第3步和第4步之间加入如下操作: 设置VTST: wgethttp://theory.cm.utexas.edu/code/vtstcode.tgz tar xvf vtstcode.tgz 下载:解压缩:之后会生成vtstcode-171目录,此目录内包含以下文件: bbm.F bdr_changes bfgs.F cg.F chain.F dimer.F dynamic.F dynmat.F fire...
PS1:补充VTST的官方教程:theory.cm.utexas.edu/vtPS2:简单总结下VTST的安装流程:首先下载并解压VASP源码,之后下载VTST的源码,然后根据教程,将VTST里的源码加入VASP源码中,此处记得要修改管理编译的隐藏文件.objects,最后编译修改后的VASP源码。 原内容 安装环境:vasp6.1+vtstcode-195 1. 从官网下载VTST的软件包时,文...
VTST是一款过渡态搜索工具,配合VASP使用。 VTST和VASP准备工作 wgethttp://theory.cm.utexas.edu/code/vtstcode-180.tgz wgethttp://theory.cm.utexas.edu/code/vtstscripts.tgz vtstcode是代码安装包,vtstscripts是一些工具脚本。 tar -zxvf vasp.5.4.4.tar.gz cd vasp.5.4.4 patch -p0 < patch.5.4.4.1605...
1.http://henkelmanlab.org/vtsttool ... vtst-code-into-vasp 2.http://hmli.ustc.edu.cn/doc...
解压vtstcode 安装包 tar –xvzf vtstcode.tar.gz 生成vtstcode-178 文件夹 设置VTST 将vtstcode-178 文件夹目录下所有文件复制到 /home/vasp.5.4.4/src/ 中(替换 chain.F ) 打开并修改 src 文件夹中的 main.F ,将 CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &LATT_CUR%A,LATT_CUR%B...
重新编译安装了一遍，不存在覆不覆盖一说 ，之前有的功能带着vtst编译也都会有。
1.以下软件需要自行单独安装 sudo apt-get install build-essential sudo apt-get install gcc-multilib sudo apt-get install libstdc++5 sudo apt-get install openjdk-6-jre-headless 以下为12.04系统默认自带,建议检查,使用g++ -v之类的代码;注意gcc和g++的版本应一致。
我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优化后结构(两个CONTCAR)的相似程度(每个对应原子的初末态距离的平方和,再开根号)。