查看是否有vtst:在vasp的bin中输入strings ./vasp_std | grep -i vtst 如果没有,则重编译VASP 1.解压 tar -xvf vasp.5.4.4.tar 2.执行以下命令备份VASP安装包“src”目录下的“chain.F”文件。 cp vasp.5.4.4/src/chain.F vasp.5.4.4/src/chain.F_bak 3.执行以下命令将“vtstcode-179”目录下文件...
详情请进:http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts.html 后面所有后缀名为pl的脚本都来自这里。 计算步骤 1. 初末态结构优化 建立两个文件夹ini(初态的意思),fin(末态),每个文件夹放入vasp计算必备的四个文件(INCAR,POSCAR,KPOINTS,POTCAR),其中的两个POSCAR对应未优化的初末态。确保两个文件夹里面除P...
CI-NEB过渡态计算步骤,练习一:O在Au(111)上的迁移 我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优化后结构(两个CONTCAR)的相似程度(每个对应原子的初末态距离的平方...
过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG为合理的值即可,在前期试算过程中设置的值为0.02 eV/Å; NEB相关的关键词含义: LCLIMB=.TRUE. #通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3 #specify that VASP does molecular dynamics; P...
tar -zxvf vtstcode-204.tgz(解压下载好的文件) 打开VASP.6.3.2源码包(这是已经安装编译完成的vasp) (1)进入src中进行一些文件编译 为了保证出错后能恢复,先将src 目录下的 main.F 复制一份 即: cd src cp main.F main.F_original vi main.F ...
在VASP-vtst计算平台中，NEB优化算法通过特定的参数设置（如IOPT参数）实现。vtst脚本包为用户提供了Perl语言编写的工具，例如dist.pl、nebmake.pl等，用于辅助NEB计算的各个步骤，包括结构优化、插点生成等。计算过程分为以下几个步骤：1. 结构优化：分别对初始态和最终态进行结构优化，确保两个优化后的...
我在并行超算平台编译好了 VASP-vtst，计算频率等任务均能正常完成，但在Dimer法寻找过渡态时，无法正常...
安装VASP中的VTST插件需要一系列步骤,包括确认系统环境和VASP版本、下载VTST软件包、解压、配置接口以及编译安装。以下是详细的步骤说明: 确认系统环境和已安装的VASP版本: 确保你的系统环境(如Ubuntu 22.04)和已安装的VASP版本(如VASP 6.3.2)与VTST兼容。 下载VTST软件包: 前往VTST的官方网站或可信的软件仓库下载...
大家好，我在编译vtst版vasp时总是出现这个错误，我时参考官网教程Installation — Transition State Tools...
解压vtstcode 安装包 tar –xvzf vtstcode.tar.gz 生成vtstcode-178 文件夹 设置VTST 将vtstcode-178 文件夹目录下所有文件复制到 /home/vasp.5.4.4/src/ 中(替换 chain.F ) 打开并修改 src 文件夹中的 main.F ,将 CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &LATT_CUR%A,LATT_CUR%B...