UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳，最出名的当属IEU OPEN GWAS（https://gwas.mrcieu.ac.uk/）。使用IEU调取UKB-gwas比较简单，直接搜索表型，然后UKBB的也会被搜索出来，通过ID直接调取就好了，IEU已经对数据重新进行了质控和检验，所需要的变量都应经存在。GWAS Catalog数据库也纳入了很多UKB数据(https://www...
UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳,最出名的当属IEU OPEN GWAS(https://gwas.mrcieu.ac.uk/)。 使用IEU调取UKB-gwas比较简单,直接搜索表型,然后UKBB的也会被搜索出来,通过ID直接调取就好了,IEU已经对数据重新进行了质控和检验,所需要的变量都应经存在。 GWAS Catalog数据库也纳入了很多UKB数据(https://www.eb...
UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳,最出名的当属IEU OPEN GWAS(https://gwas.mrcieu.ac.uk/)。 使用IEU调取UKB-gwas比较简单,直接搜索表型,然后UKBB的也会被搜索出来,通过ID直接调取就好了,IEU已经对数据重新进行了质控和检验,所需要的变量都应经存在。 GWAS Catalog数据库也纳入了很多UKB数据(https://www.eb...
使用IEU OPEN GWAS 数据库调取UKB-gwas 数据非常便捷。只需搜索感兴趣的表型，数据库将自动列出包括UKB在内的相关研究。IEU 已对数据进行了质量控制和验证，使得研究者可以轻松访问所需变量。GWAS Catalog 是另一个数据资源，同样包含UKB 的GWAS 数据，但与 IEU OPEN GWAS 相比，更新速度更快。内部消息...
汇总数据-IEU open GWAS PART 04 1. 基本信息 包括了来自UKbiobank的数据 2. 网站链接 https://gwas.mrcieu.ac.uk/ 对于上述庞杂的数据,医豌豆工作室开发了专用的服务器、R包,汇总了近百T数据! 一、对于汇总数据的phewas分析: ①开发全网首发mrasst包(专用作phe-was汇总数据运算):封装了整个phewas过程中的...
来自nature的ukb的21个社会行为特征数据 2023年7月一篇在 Nature Human Behaviour 期刊发表的研究指出,当前的UKB数据用于MR分析时,可能忽略了社会行为学对GWAS的影响。许多常研究的因素会影响研究参与 - 医工科研-孟德尔随机化于20240525发布在抖音,已经收获了1591个喜
UKBBphenotype数据处理流程:https://github.com/Nealelab/UK_Biobank_GWAS/tree/master/imputed-v2-gwas phenotype 处理工具:Millard LAC, Davies NM, Gaunt TR, Davey Smith G, Tilling K. PHESANT: a tool for performing automated phenome scans in UK Biobank. bioRxiv (2017) https://github.com/astheegg...
GWAS across all analyzable phenotypes and diverse ancestry groups in the UK Biobank. A full description of how these summary statistics were generated and how to work with them can be found here:http://pan.ukbb.broadinstitute.org/. Code overview ...
1522 -- 1:03:00 App 孟德尔随机化之pan_ukbb数据转化 3701 1 1:02 App 孟德尔随机化之GWAS catalog下载的关联SNP转化 2881 -- 21:01 App 孟德尔随机化之LDSC和MRlap分析 1311 1 2:51 App 孟德尔随机化之可药物性基因数据获取 2625 2 29:49 App easyMR之药物靶向孟德尔随机化流程 1486 -- 10...
看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的: For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing both genome-wide genotypes and rich phenotypic data on 500,000 people to the international research community.