UKB-PPP pQTL数据非常不友好，下载下来是不能直接分析的，因为数据按照染色体分开存放的，更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID，根本没有办法分析。既然下载好的数据是分开的，又没有SNP ID，想进行数据分析必须进行数据合并和SNP ID转换，这个就麻烦了，因为这些操作需要大量的硬盘空间、强大的CPU、内存，普通电脑根本...
自己可以下载自己需要的pqtl数据,也可以全部下载来,不过全部下载下来是比较困难的,因为这里有2940个文件,搞下来就高达2T数据,没有稳定的、高速的网络根本行不通。 UKB-PPP pQTL数据非常不友好,下载下来是不能直接分析的,因为数据按照染色体分开存放的,更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID,根本没有办法分析。
Ile300Thr)的反式中的C1QL2水平;具有错义因子B(CFB)变体的反式中的前肽(CFP)水平(rs4151667,Leu9His);因子B和CFP水平与CFI和C3的反式pQTL;在COLEC11具有反式pQTL的FCN1水平;以及C3、因子B、CFP和CD59水平与CFH-CFHR1-5基因座...
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1.下载解压合并和转化SNP,暴露数据直接拿去用[118.UKB_PPP数据(pQTL)下载和暴露处理(M80)] 42 0 03:39 App 11.GO富集分析【英国UKB_PPP数据1923个蛋白(pQTL)孟德尔随机化(生信私学M81)】 99 0 02:21 App 07.取冰岛pQTL与乳酸化交集数据 481 0 13:47 App 01.课程简介【115.多组学eQTL/pQTL 孟德尔随...
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研究团队整合了来自UKB Pharma蛋白质组学项目的蛋白质定量性状位点(pQTL)数据,该项目研究了约3,000种血浆蛋白的遗传关联。在所有PC1 GWAS显著位点中,确定了2,905个重叠的pQTL。评估显示,在266个重叠pQTL(9%)处存在调节端粒长度和血浆蛋白丰度的共享因果变异,其中10个为顺式pQTL,256个为反式pQTL。
该研究采用了前瞻性队列研究和遗传学方法,基于Olink蛋白组学平台提供了对血浆蛋白与癌症风险之间关系的深入分析:确定了618种蛋白与至少一种癌症的风险相关;其中107种蛋白,在血液抽取后超过7年被诊断出的病例中,仍然与癌症风险相关;29种蛋白在遗...
现在来看看这个问题,首先我们可以百度一下UKB-PPP pQTL找到下载的网址,具体如下:https://www.synapse.org/Synapse:syn51364943/wiki/622119 登录后可查看图片 需要用邮箱注册一个账号,然后登录进去,点击Files就可以进入如下的界面就可以找到了下载的地方: 登录后可查看图片 登录后可查看全文...
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