UKB-PPP pQTL数据非常不友好,下载下来是不能直接分析的,因为数据按照染色体分开存放的,更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID,根本没有办法分析。 既然下载好的数据是分开的,又没有SNP ID,想进行数据分析必须进行数据合并和SNP ID转换,这个就麻烦了,因为这些操作需要大量的硬盘空间、强大的CPU、内存,普通电脑根本无从...
再生元制药作为UKB-PPP项目跨国药厂之一,联合宾夕法尼亚大学医学生物样本库等多家机构,利用大规模队列蛋白基因组学研究,近期在国际顶刊Nature( IF= 50.5)主刊发表最新研究结果:团队发现的人免疫球蛋白G4基单克隆抗体REGN5381,作为NPR1受体新型激动剂,通过特异性降低心力衰竭患者异常升高的中心静脉压,可提供一种长效治...
Nature | Vol 622 | 2023年10月12日| 331与整个UKB队列相比,UKB-PPP参与者在Bonferronicorrelated阈值P < 6.7 × 10−5(0.05/746种疾病),经多次比较调整后,测试的疾病没有显著减少(图1c和补充表2)。这种富集在很大程...
现在来看看这个问题,首先我们可以百度一下UKB-PPP pQTL找到下载的网址,具体如下:https://www.synapse.org/Synapse:syn51364943/wiki/622119 登录后可查看图片 需要用邮箱注册一个账号,然后登录进去,点击Files就可以进入如下的界面就可以找到了下载的地方: 登录后可查看图片 登录后可查看全文...
1.下载解压合并和转化SNP,暴露数据直接拿去用[118.UKB_PPP数据(pQTL)下载和暴露处理(M80)] 42 0 03:39 App 11.GO富集分析【英国UKB_PPP数据1923个蛋白(pQTL)孟德尔随机化(生信私学M81)】 99 0 02:21 App 07.取冰岛pQTL与乳酸化交集数据 481 0 13:47 App 01.课程简介【115.多组学eQTL/pQTL 孟德尔随...
UKB-PPP此次发布的研究进展将是对血浆蛋白组学遗传图谱的一次重要更新,并为科学界提供了一个具有更深广度及深度的人群蛋白组学开放资源数据库,以帮助进一步揭示遗传信息一级编码——基因背后的表型和生物机制。对人群队列进行上千种蛋白标志物的分析研究,...
###UKBPPP数据处理### folder_path <- "D:/mendelian_randomization/brugada syndrome/ukbPPP蛋白靶点鉴定/ukbppp下载欧洲/YY1_P25490_OID30446_v1_Inflammation_II/" untar(tar_file) files <- l…
伯豪生物全称上海伯豪生物技术有限公司,在生命科学领域为科研工作者提供技术支持及服务、科研试剂产品的公司。主营业务:单细胞测序、单细胞核测序、单细胞ATAC测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、空间基因测序、空间转录组测序、FFPE空间转录组测序等,多组学科研技术服
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赛默飞世尔科技旗下Olink平台被选中支持全球最大规模的人类蛋白组学研究。英国生物样本库制药蛋白组项目(UKB-PPP)旨在创建人体疾病相关蛋白水平的全面图谱,以推进生物标志物的发现