2023年10月发布了 UK biobank 的蛋白质组学 pQTL 数据数据( UKB - PPP ) 数据质量依然非常好,有多祖先的数据,每种数据里有2940个蛋白的 pQTL 但是该数据下载非常麻烦,需注册,登录,专门的软件下载,还有网速和电脑要求,未解压缩时大约2T,下载后需要进行数据清洗后方能使用!普通的笔记本电脑及个人电脑难以完成该操...
英国生物样本库制药蛋白组学项目(UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)已采用Olink Explore™ 平台结合Illumina NovaSeq™ 6000测序平台,对54,406人参与的蛋白组学项目进行系统研究。 这种基于NGS的蛋白质组学技术充分利用了Olink PEA技术的高灵敏度和高特异性,以及Illumina经典 SBS测序技术的高准确性和高...
Nature | Vol 622 | 2023年10月12日| 331与整个UKB队列相比,UKB-PPP参与者在Bonferronicorrelated阈值P < 6.7 × 10−5(0.05/746种疾病),经多次比较调整后,测试的疾病没有显著减少(图1c和补充表2)。这种富集在很大程...
发布了头条文章:《英国生物样本库UKB-PPP开创性蛋白组学研究进展首批发布》 英国生物样本库(UK Biobank, UKB)是目前世界上最大、最全面的生物医学数据库和研究资源之一,致力于对生物样本进行高通量蛋白组检测,已联合由十家顶级生物制药公司组成的联盟启动一项全球最大的血液蛋白组研究。这将是迄今为止进行的全球最大的...
UKB-PPP使用Olink平台表征了 54,219 名UKB参与者的血浆蛋白质组学特征,并收集了2,923种蛋白质的数据。 2. 数据下载链接 https://www.synapse.org/#!Synapse:syn51365301 3. 数据来源文献 Sun BB et al. Plasma proteomic associations with genetics and health in the UK Biobank. Nature. 2023 Oct;622(79...
folder_path <- "D:/mendelian_randomization/brugada syndrome/ukbPPP蛋白靶点鉴定/ukbppp下载欧洲/YY1_P25490_OID30446_v1_Inflammation_II/" untar(tar_file) files <- list.files(folder_path, pattern = "*.gz", full.names = TRUE) data_list <- lapply(files, fread) ...
ukbppp东亚蛋白组学数据 #医工科研云上GWAS #医工科研kim老师 @抖音小助手 @抖音创作者中心 - 孟德尔随机化课程客服于20240613发布在抖音,已经收获了241个喜欢,来抖音,记录美好生活!
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UKB-PPP此次发布的研究进展将是对血浆蛋白组学遗传图谱的一次重要更新,并为科学界提供了一个具有更深广度及深度的人群蛋白组学开放资源数据库,以帮助进一步揭示遗传信息一级编码——基因背后的表型和生物机制。对人群队列进行上千种蛋白标志物的分析研究,...
英国生物样本库(UK Biobank, UKB)是目前世界上最大、最全面的生物医学数据库和研究资源之一,致力于对生物样本进行高通量蛋白组检测,已与由十家顶级生物制药公司组成的联盟联合,启动了一项全球最大的血液蛋白组研究。这将是迄今为止进行的全球最大的血液蛋白组研究之一,旨在显著增强“蛋白质组学”的领域,使人们对疾病...