study (TWAS) with UTMOST and FUSION for seven upper GI diseases (oesophagitis, gastro-oesophageal reflux disease, other diseases of oesophagus, gastric ulcer, duodenal ulcer, gastritis and duodenitis and other diseases of stomach and duodenum) based on summary GWAS statistics from UK Biobank. In...
R script to update summary statistic files (Rapid_GWAS_low_confidence_filter_update.R)[https://github.com/Nealelab/UK_Biobank_GWAS/blob/master/Rapid_GWAS_low_confidence_filter_update.R] Requires data.table 1.12.2 R package Requires GWAS_list_low_confidence_filter_update.txt.gz file (or subse...
我们之前讲过如何快速简单地下载finngen数据库的完整GWAS数据,孟德尔随机化使用的GWAS数据大家最常用的有2个,一个是finngen,另外一个就是UK biobank,这次我们讲怎样获得性别分层的UK biobank数据库里的GWAS数据。 个人级别的数据是不公开的,而Summary级别的数据是公开的,IEU数据库就是有UK biobank数据的,无需性别分层...
Tools for preprocessing, QC, and preliminary analyses from raw UK BioBank data gwasphewasukbiobankgrmgwas-summary-statisticsld-score-regressionphenotyping-algorithmsglobal-biobank-engine UpdatedAug 5, 2022 Jupyter Notebook Preparatory scripts for BIDS tabular phenotypic data in large neuroimaging datasets. ...
R script to update summary statistic files (Rapid_GWAS_low_confidence_filter_update.R)[https://github.com/Nealelab/UK_Biobank_GWAS/blob/master/Rapid_GWAS_low_confidence_filter_update.R] Requires data.table 1.12.2 R package Requires GWAS_list_low_confidence_filter_update.txt.gz file (or subse...
背景:与普通人群相比,精神分裂症和抑郁症患者的吸烟率更高。孟德尔随机化(MR)可以利用全基因组关联研究(GWAS)中发现的遗传变异来研究这种关联是否是因果关系。 方法:我们进行了双样本MR,探讨吸烟对精神分裂症和抑郁症的双向影响。对于吸烟行为,我们使用了(1)来自GSCAN联盟的吸烟开始的GWAS,以及(2)我们在英国生物库...
通过重新发布UK Biobank基因型估算(我们称其为impulated-v3),我们为遗传学界生成了一套更新的GWAS摘要统计信息。 应用UKB31063和addtl增加了表型的数量。 自定义策展表型(请参阅估算的v3表型) 更自由地包含样本(请参阅估算的v3样本质量控制) 包含更多SNP(请参阅估算的v3变体质量控制) 更新了我们的关联模型(impte...
UK biobank中GWAS数据下载链接An**us 上传6.14MB 文件格式 xlsx excel UK biobank中GWAS数据下载链接 点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:1 积分 电信网络下载 云计算大数据中心第三次作业 2024-12-04 21:19:01 积分:1 植物大战僵尸123456.sb2 2024-12-04 20:26:55 积分:1 ...
First, it relied on publicly available GWAS summary statistics from the UK Biobank dataset for all the neuroimaging traits analyzed. Although this is a powerful resource and one of the largest and most homogeneous brain imaging genetics datasets to date23, the participants in this dataset are of ...
.英国生物库演示用户指南:入门 1 简介 英国生物库拥有2006年至2010年间在英国招募的50万40-69岁参与者(男女人数大致相等)的前所未有的数据。展示(可在http://www.ukbiobank.ac.uk)旨在以全面简洁的方式提供可用于健康相关研究的数据,并为考虑申请使用该资源的...