最耗时的步骤已经是过去了,理论上这个时候star-fusion流程内部的一个perl脚本去解析star比对过程中输出的Chimeric.out.junction文件就可以完成融合基因的搜索啦。 但是STAR-Fusion流程就报错 我看了看这个运行日志,以及对应的报错信息: Running CMD: /home/data/fusion/miniconda3/envs/starFusion/lib/STAR-Fusion/util...
# trim,star 两个软件即可 conda create-n starFusion conda activate starFusion conda install-c bioconda trim-galore conda install-c bioconda star-fusion 可以看到目前两个软件版本是: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 STAR--version2.7.10aSTAR-Fusion--versionSTAR-Fusion version:1.6.0...
使用安装好的conda来 安装软件的代码如下所示: # trim,star 两个软件即可 conda create -n starFusion conda activate starFusion conda install -c bioconda trim-galore conda install -c bioconda star-fusion 可以看到目前两个软件版本是: STAR --version 2.7.10a STAR-Fusion --version STAR-Fusion version...