首先获得对应数据的ACC号。这个在NCBI中选择好数据后,选择send to - file - Acc list然后下载即可 Acc号获取 对于单个的数据文件可以直接使用 prefetch SRR_acc 即可下载 prefetch SRR_acc 若要批量下载则先把acc号存放到一个内(直接下载的csv文件即可) prefetch -option-file Acc_number_file.csv 下载完成后可以...
从NCBI网站上进SAR,找到自己感兴趣的数据 选择sent to 然后选择Run selector,然后GO,他会输出一个SRR_Acc_List.txt,这个文件里面包含了你想要的数据的编号,之后可以通过这个文件批量下载,或者通过里面的编号一个一个下,里面的内容都是SRRxxxxxx 想要下载这些数据时,可以参考这个帖子 https://blog.csdn.net/m0_695...
##单行手动下载 prefetch SRR3182423 ##批量自动化下载 cat SRR_Acc_List.txt | while read id do prefetch ${id} -O ./ done 数据格式 SRA数据格式,是NCBI数据库的格式,我们下载之后,需要自己手动转换成fq格式。 SRA的数据是每一个SRR数据,是一个文件夹。