conda install -y sra-tools 官网下载 除了使用conda直接配置安装以外,我们还可以通过其官网[2]选定适合自己的操作系统下载。 wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz tar -zxvf sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz # 解压缩 echo 'export PATH=$PATH:$...
升级了0个软件包,新安装了0个软件包,要卸载0个软件包,有0个软件包未被升级。 installing sra toolkit to/usr/local/ncbi%Total%Received%XferdAverageSpeedTimeTimeTimeCurrentDloadUploadTotalSpentLeftSpeed10089.9M10089.9M001127k00:01:210:01:21--:--:--714kPlease'source /etc/profile.d/sra-tools.sh'to ...
安装 conda create -c conda-forge -cbioconda-n kingfisher pigz python extern curlsra-toolspandas requests aria2conda activate kingfisher#使用conda activate不能成功激活环境时可以尝试使用:source activate kingfisherpip install bird_tool_utils'>='0.2.17git clonehttps://github.com/wwood/kingfisher-download...
conda install-y sra-tools 官网下载 除了使用conda直接配置安装以外,我们还可以通过其官网[2]选定适合自己的操作系统下载。 代码语言:javascript 复制 wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz tar-zxvf sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz # 解压缩 echo'...
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit 可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64 bit architecture,直接点击就可以下载压缩文件。下载完成后,将压缩包放在软件将要安装的文件夹(文件夹路径最好不要包含中文),解压即可使用。举例来说,我们直接放在D盘下面,解压就可以 2、环...
安装 condacreate-c conda-forge -c bioconda -n kingfisher pigz python extern curl sra-tools pandas requests aria2condaactivatekingfisher#使用conda activate不能成功激活环境时可以尝试使用:source activate kingfisherpipinstallbird_tool_utils'>='0.2.17gitclonehttps://github.com/wwood/kingfisher-downloadcd ...
也可以使用bioconda直接进行安装,需要注意的是软件的名字在bioconda中是sra-tools。 conda install sra-tools 软件的用法也比较简单,根据命名我们就可以看出来,它是一个处理sra格式文件的工具包。可以用来管理和操作sra数据库的资源,里面包含了很多工具。可以处理多种测序平台的数据,这些工具大部分根据命名就知道功能。
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit 可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64 bit architecture,直接点击就可以下载压缩文件。下载完成后,将压缩包放在软件将要安装的文件夹(文件夹路径最好不要包含中文),解压即可使用。举例来说,我们直接放在D盘下面,解压就可以。 2、环...
安装 代码语言:javascript 复制 conda create-c conda-forge-c bioconda-n kingfisher pigz python extern curl sra-tools pandas requests aria2 conda activate kingfisher #使用conda activate不能成功激活环境时可以尝试使用:source activate kingfisher pip install bird_tool_utils'>='0.2.17git clone https://git...
主营产品:卡特、沃尔沃NOV/MISSION米森/VARCO华高/M/D马丁戴克 供应商:泉州市易配动力技术有限公司 所在地:中国 联系人:蒋真真 联系电话 点此询价 QQ咨询 买家还在看 河南游艇制造厂雅特船舶供应Yat700小... 供应SPJETRINGJ-I逆功率继电器 卡特喷油嘴、沃尔沃喷油嘴 ...