比较项目Smart-seq210x Genomics Chromium 细胞通量低（通常每次96个细胞）高（每次可测数千个细胞）测...
这表明 Smart-seq2(48% reads 比对到外显子)和 Smart-seq(30% reads 比对到外显子)较 UMI 方案(均低于 15% reads 比对到外显子)有更好的测序质量。 基因检测效率对比 图.不同单细胞技术测序深度和基因检出数对比 采用抽样的饱和度分析对测序深度进行评估,当测序深度达到 100 万reads时,这六种测序方法均...
这表明 Smart-seq2(48% reads 比对到外显子)和 Smart-seq(30% reads 比对到外显子)较 UMI 方案(均低于 15% reads 比对到外显子)有更好的测序质量。 基因检测效率对比 图.不同单细胞技术测序深度和基因检出数对比 采用抽样的饱和度分析对测序深度进行评估,当测序深度达到 100 万reads时,这六种测序方法均...
Smart-seq3xpress—全长转录组测序,为您深度解析单细胞 28:38 “新”“新”向荣,求索不止——GEM-X & Flex专题线上讲座 17:18 让AI为科研赋能——百奥智汇“单细胞+AI”主题系列直播第一讲 49:28 所见即所得,视界新选择---Visium HD专题讲座 26:05 百奥智汇“单细胞+AI”主题系列直播第二讲...
Smart-seq2和10X技术是单细胞转录组测序两种常用的方法。它们在样本处理、测序深度、覆盖度和数据分析等方面存在一些区别。 一、样本处理: 1.Smart-seq2: 这种方法需要对单个细胞进行分离和捕获,然后进行细胞裂解和逆转录反应,最后进行扩增和测序。这种方法通常需要较长的操作时间和较高的技术要求。
Smart-seq技术于2012年公布,Smart-seq2是升级版技术。Smart-seq2是可以检测mRNA全长的单细胞转录组测序技术,也可⽤于分析可变剪切。 Smart-seq2技术利用oligo-dT30VN作为反转录起始引物进行逆转录,逆转录至mRNA的5’端帽子结构时,利用MMLV酶的模板置换的活性,利用TSO作为模板,继续逆转录,进而添加5’通用序列。其...
C1/Smart-seq平台, 每次只能分析96个细胞,然后分别获得每个细胞的全长cDNA文库,并可在用户选择的孔中对文库进行额外测序,因此可以获得每个细胞的深入转录组信息。这里关于测序深度,曾老师之前的推文有提出质疑,觉得应该是1M-10M为佳,不太可能是100-1000个M。
二者操作上的区别，就是smart-seq属于low-throughput（直白的说就是在96孔板、或者384孔板、或者PCR管...
▲SMART-seq2 技术原理 伯豪生物提供:单细胞转录组测序、生信分析整体科研技术服务,伯豪生物单细胞转录组测序优研服务商,24 小时咨询服务热线:021-58955370 1、起始量低:1 个细胞起始,适用于难以满足 10X Genomics 等平台起始细胞量要求的样本。 2、覆盖度高:测序覆盖 cDNA 的全长序列,每个细胞能够获得上万个基因...
SMART-seq(Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript)是2012年开发的一种单细胞转录组测序技术,它的原理是通过在反转录过程中引入一个定制引物,将细胞内的RNA转录本进行全长合成,使得可以获得单细胞水平上更详细和全面的基因表达数据。 2013年,Nature Methods 杂志上报道了 SMART-seq2,该技术是经 SMAR...