例如CellMarker（28），PangaloDB（29）和ImmuCellDB（30），它们利用通过文献手工核查确定的特定于细胞类...
单细胞空间转录组测序：从组织到单细胞 单细胞ATAC测序：单细胞表观基因组学水平染色质可及性 单细胞蛋...
开发出一种SCI-seq (single-cell combinatorial indexed sequencing,单细胞组合标记测序技术),多次对细胞进行条形码编码标记后对它们进行测序,可以同时构建上千个单细胞文库,检测体细胞拷贝数的变异。
2017年3月,美国俄勒冈的研究人员在Nature Methods上发表“Sequencing thousands of single-cell genomes with combinatorial indexing (doi:10.1038/nmeth.4154) ”文章,开发出一种SCI-seq (single-cell combinatorial indexed sequencing,单细胞组合标记测序技术),多次对细胞进行条形码编码标记后对它们进行测序,可以同时构建...
很高兴借助知乎平台,总结并分享自己的关于单细胞测序技术的学习笔记,欢迎知友们能够一起探讨问题。希望在大家的帮助与建议下,能够分享出全知网最优秀的文章来总结技术。为了区别现在的文章思路(翻译),我的写…
这三个文件指的是：barcodes.tsv、features.tsv、matrix.mtx。barcodes.tsv就是cell id，features.tsv...
11月加州大学圣地亚哥分校张鹍教授团队在PNAS上发表题为“Ultra-accurate Genome Sequencing and Haplotyping of Single Human Cells (doi: 10.1073/pnas. 1707609114)”的文章。开发了一个名为“SISSOR” (微流体反应器法单链测序)的方法,用来进行准确的单细胞基因组测序和单倍体分型。
今天小编和大家分享一篇22年11月发表在Frontiers in Immunology(IF:8.786)杂志的文章《Identification and validation of a signature based on macrophage cell marker genes to predict recurrent miscarriage by integrated analysis of single-...
单细胞测序技术( singlecellsequencing) 前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中,最前沿的则是单细胞测序 技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞,得到的变异水平也是成千上万个细胞的平 均后水平。但是,就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样,没有两个细胞是完全相同 的。所以,单...
University of Texas researchers have developed a high throughput method for sequencing individual B cell immunoglobulin receptors that keeps the link between their paired heavy and light variable chains intact. The next step is modifications to increase throughput and accuracy.Lauren Martz...