不过通常KNN算法中使用的是欧式距离(全称:欧几里得度量),先拿二维平面为例,二维空间两个点的欧式距离计算公式如下: 其实它和我们高中数学中在坐标系中计算两点之间的距离一样,比较简单。如果拓展到多维空间,那公式如下: 应用到单细胞转录组细胞聚类中,欧式距离的公式都代表什么呢?其实d(x,y)表示两个细胞之间的距离...
伯豪生物全称上海伯豪生物技术有限公司,在生命科学领域为科研工作者提供技术支持及服务、科研试剂产品的公司。主营业务:单细胞测序、单细胞核测序、单细胞ATAC测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、空间基因测序、空间转录组测序、FFPE空间转录组测序等,多组学科研技术服
就是判定邻近的模块有两个:annoy、rann 其中这个annoy全称又叫做Approximate Nearest Neighbors Oh Yeah,名字还蛮可爱的。 下面这位博主对于这个算法有非常详细的解释,有兴趣的家人们自行前往观看。 FindNeighbors {Seurat} - 简书 (jianshu.com) 七、FindClusters() 就是在已经计算完细胞之间的距离之后,对这些细胞进行...
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scRNA-seq,全称为单细胞转录组测序技术(Single Cell RNA Sequencing),是一种对单个细胞的基因表达进行检测和分析的方法 2楼2023-12-29 08:44 回复 BAGN 通过该方法可以深入了解每个单独的细胞类型、揭示其功能和调控机制以及发现新的潜在药物靶点等,因此在生物医药领域具有广泛的应用前景 3楼2023-12-29 08:44...
序号登记日期软件全称软件简称登记号版本号 12024-11-22单细胞基因绘图工具软件ScGenePlot2024SR1869603V1.0 22024-09-12生物信息收集表格及报告展示软件Report_excel_info_website2024SR1363812V1.0 32024-09-12xenium生物信息分析软件Xenium_tools2024SR1361549V1.0 ...
软件名称高通量scRNA-seq快速推断肿瘤细胞软件 软件简称scEntroy_v1版本号V1.0 登记号2024SR0634878分类号- 著作权人天津诺禾致源生物信息科技有限公司首次发表日期- 登记日期2024-05-11 该公司其他软件著作权 序号登记日期软件全称软件简称登记号版本号
我本人也是刚接触scRNA-seq,所以写的东西可能比较小白,还请大家多指导。最近阅读的一篇nb上的文章,写一点东西,一方面给自己,一方面大家一起交流,闷着肯定不行。 MNN,英文全称mutual nearest neighbor,互近邻,互就是互相的,近邻就是最近的邻居。这个MNN用在这里还是非常的贴切。MNN主要思想就是找到不同批次中相同的细...
什么是Seq2SeqSeq2Seq模型,全称Sequence to sequence,由Encoder和Decoder两个部分组成,每部分都是一个RNNCell(RNN、LSTM、GRU等)结构。Encoder将一个序列编码为一个固定长度的语义向量,Decoder将该语义向量解码为另一个序列。输入序列和输出序列都可以是不定长序列。Seq2Seq可以用于机器翻译、文本摘要生成、对话生成等...