目前,各种测序技术已经成为了药物研发过程中的得力工具。单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq),简单从字面理解,就是一种在单细胞水平上对转录组进行测序分析的技术。目前,这项技术已经得到了广泛地应用,并在应用中不断地快速发展,成为我们研究细胞类别、疾病发生过程等问题的有力工具。 为什么要用...
scRNA-seq技术在肿瘤生物学研究中的应用 ScRNA-seq技术以其在单细胞水平上对整个转录组的深入分析,彻底革新了我们对肿瘤生物学的认识。这一技术在揭示肿瘤内部的复杂异质性、识别肿瘤的不同亚克隆、描绘肿瘤与免疫细胞间的相互作用、解析肿瘤相关的信号传导路径,以及预测药物反应和抗药性方面扮演了关键角色。它不仅使我...
利用单细胞测序 技术可获得更全面的肿瘤分子特征,包括药物作用靶 点、放化疗抗性标志物等,通过靶向特殊分子设计并 完善治疗方案。结合针对 CTCs 的单细胞测序技术可 实时监测肿瘤细胞异质性的变化,在治疗过程中针对 其分子特征调节治疗方案。 单细胞测序技术还可对肿瘤微环境及免疫微环境 进行分析,可能为临床免疫治疗提...
新的证据表明,t-SNE和UMAP更适用于scRNA-seq数据,这些数据已广泛用于单细胞分析,用于数据可视化和细胞群体识别。然而,t-SNE通常受到限制,例如大规模scRNA-seq数据集的计算时间慢,并且全局数据结构没有得到保存。UMAP具有上述两个方面的优势,目前成为最流行的降维选择。 细胞亚群的鉴定 scRNA-seq的关键应用之一是基于细...
scRNA-seq,即单细胞转录组测序(Single-cell RNA Sequencing),是一种在单细胞水平上研究基因表达差异的技术。该技术通过测序单个细胞中的RNA转录本,揭示每个细胞独特的基因表达模式,为细胞异质性研究提供了强有力的手段。scRNA-seq技术不仅能够帮助科学家们更深入地理解细胞的功能、...
scRNA-seq应用于未分化的PSCs研究 自2012 年 Smart-Seq 出现以来,scRNA-seq技术在人类 ESCs 上开始应用。基于 scRNA-seq 分析,人类ESCs 被分为8个细胞群,并且可以分析共调控基因模块。此外,使用人类植入前胚胎和胚胎干细胞,绘制了第一个长链非编码 RNA 表达图谱 ,作为首次使用人类ESCs 进行的单细胞转录组分析,这...
内容概要:介绍了scRNA-seq技术的基本过程和发展,并探讨了其在癌症研究和临床实践中的应用。癌症是一组异质性疾病,scRNA-seq技术可以帮助我们理解肿瘤异质性和肿瘤微环境,从而更好地了解肿瘤发生、进展、转移和药物耐受性的机制。 2、内源性腺嘌呤介导糖尿病模型的肾损伤并预测患者的糖尿病肾病 ...
(1)scRNA-seq:从14例BC患者中取原发肿瘤病变及周围正常组织进行单细胞转录组测序,质控后获得124587个高质量细胞。 (2)bulk RNA-seq:公共数据库中BC队列(GSE7390, GSE58812)数据。 研究结果 1.单细胞转录组识别乳腺癌的肿瘤微环境 对单细胞数据进行无监督聚类,鉴定出7个细胞类型,细胞频率分析发现这些细胞类型在...
单细胞RNA测序技术详解:原理流程与步骤应用 单细胞RNA测序,通常简称为scRNA-seq,是一项革命性的生物技术,已经改变了我们对生命科学的理解方式。这项技术使研究人员能够深入了解单个细胞的基因表达模式,揭示了生物体内的细胞异质性和功能多样性。在本文中,我们将探讨单细胞RNA测序的意义以及它在生物研究中的应用。
2、 单细胞技术意义及应用 单细胞转录组测序(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)对组织中的细胞进行独立分析,在细胞图谱构建、细胞亚群细化及稀有细胞类型鉴定、疾病标志性致病基因及干细胞发育分化等过程中发挥重要作用。单细胞转录组学在人类健康方面主要涉及发育研究、免...