scRNA-seq降维聚类发现,缺失Zeb2只导致转化态SMC的转录组和表型变化(Fig 4A-4C)。对谱系追踪的SMC细胞亚群细分,缺失Zeb2显著降低转化态SMC细胞数目(Fig 4D-4I),总SMC细胞数不变的情况下,CMC细胞百分比增加,FMC细胞百分比降低(Fig 4H-4I),敲除Zeb2促进SMC向CMC转化,类成纤维细胞的重塑态SMC基因MMP3和Cxcl12表达降...
single nucleus RNA-sequencing16(snRNA-seq) single-cell ATACseq (scATAC-seq) 研究结果 1. 单细胞转录组和染色质可及性分析揭示了人类心脏中的多种细胞类型 分别保留了snRNA-seq中49359个细胞和scATAC-seq中26714个细胞。确定了八种主要细胞类型,约70%的细胞来自心肌细胞(CMs)、成纤维细胞和内皮细胞。收集了...
伯豪生信云伯豪学院 助力科研探索,解读基因奥秘!首页 伯豪学院 科研动态 文献解读 |scRNA-seq 联合 scATAC-seq 解析 ZEB2 调控动脉粥样硬化表观遗传景观 伯豪课堂 科研动态 应用文献 分析工具 资料下载 文献解读 |scRNA-seq 联合 scATAC-seq 解析 ZEB2 调控动脉粥样硬化表观遗传景观发布时间:2023-07-10 浏览次数:22...
scATAC-seq是“单细胞的染色质转座酶可及性的高通量测序”。 这是一种检测单个细胞中染色质在什么位置松开的方法,相应地能够得到转录因子在什么位置能够与基因启动子结合、细胞的哪些基因可能被高效转录的信息。 本视频介绍工作原理和对分析报告的解读。
【陈巍学基因】从技术角度解读从二氧化碳合成淀粉的论文 30522:32 【陈巍学基因】对镰刀贫血细胞做单碱基编辑以救治小鼠 30822:41 【陈巍学基因】大规模单细胞ATAC、RNA含量、蛋白含量测序 484621:55 【陈巍学基因】LIBRA-seq革命性的单克隆抗体开发方法 19224:31 【陈巍学基因】小分子诱导BCL6聚合并引发BCL降解 ...
scATAC-seq降维聚类发现(Fig 3B),缺失Zeb2广泛改变转化态SMC细胞的染色质可及性(Fig 3C)。SMC细胞亚群细分,转化态SMC主要存在于Zeb2敲除的样本中(Fig 3D-3E),成熟SMC标记基因Cnn1等的染色质可及性增加(Fig 3F-3G),意味着Zeb2在转化态SMC中具有抑制成熟SMC标记基因的作用,还可能抑制SMC转化为软骨细胞表型。差异...
scATAC-seq降维聚类发现(Fig 3B),缺失Zeb2广泛改变转化态SMC细胞的染色质可及性(Fig 3C)。SMC细胞亚群细分,转化态SMC主要存在于Zeb2敲除的样本中(Fig 3D-3E),成熟SMC标记基因Cnn1等的染色质可及性增加(Fig 3F-3G),意味着Zeb2在转化态SMC中具有抑制成熟SMC标记基因的作用,还可能抑制SMC转化为软骨细胞表型。差异...
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