为验证片段复制对拟南芥和水稻基因组中SBP-box基因家族扩张的作用,本研究采取了两种方式对片段重复加以验证。首先根据TIGR对拟南芥和水稻基因组的注释结果,将所有的SBP-box基因定位于染色体上,并对比已经定义的染色体之间的片段重复(拟南芥基因组的片段复制:http://www.tier.orb/tdb/e2k1/athl/Arabidopsis-genome duplica...
利用MEME程序(http://meme.sdsc.edu/meme/intro.html)对拟南芥和水稻SBP-box基因家族成员鉴定保守性基序,除发现的最大基序数目为40外,其余参数为默认。为预测这些保守性基序的功能,对这些序列的一致性序列ScanPROSITE(http://expasy.org/tools/scanprosite/)检索PROSITE数据库中对应的功能性基序。 3. Ka和Ks的计算 ...
SBP-box基因家族是植物特有的一个基因家族,广泛存在于绿色植物中,其编码的蛋白被认为是一种转录因子,该转录因子含有一个非常保守的SBP区,这个区域包括一个新的锌指结构和一个核定位信号.研究表明SBP转录因子参与了花的形成及其后期发育,叶的形态建成和环境信号应答等多个生物学过程,在植物的生长和发育中起着重要作用...
(1福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福州350002;2中国农业科学院深圳农业基因组研究所,广东深圳518120)摘 要:S Q U AM O S A 启动子结合蛋白(S B P -b o x )是植物特异性转录因子,在植物生长发育中发挥重要作用㊂该研究利用生物信息学分析方法,对不同 铁观音 ㊁ 黄棪 ㊁ 舒茶早 和 ...
1.柳枝稷SBP-box类转录因子PvSPL2的全长CDS,其特征在于:核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。 2.根据权利要求1所述的PvSPL2的全长CDS编码的氨基酸序列,其特征在于:氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。 3.根据权利要求1所述的PvSPL2的核苷酸序列经嵌合抑制子SRDX形成的融合片段PvSPL2-SRDX,其序列如SEQ ID NO.6所示...
SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子,其功能涉及作物遗传改良的许多方面,如产量,株型,抗逆性等,具有重要的实际应用价值.本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolor L.)全基因组中鉴定出18个SBP-box基因,分布于9条染色体上,其中8个基因位于基因组重复区域.系统...
SBP (SQUAMOSA promoter binding proteins)家族是植物特有的一类转录因子家族,广泛存在于绿色植物中,调控植物生长发育,信号转导及响应非生物胁迫等多种生理过程.已有多种植物SBP-box基因相继被报道.为探究SBP-box基因在甘薯中的分布情况及对甘薯生长发育的影响,本研究从甘薯全基因组鉴定出30个SBP-box基因,依次命名为IbS...
本发明公开了一类柳枝稷SBP‑box类转录因子在增加植物生物量和可发酵糖产量方面的应用,属于植物基因工程技术领域。其主要内容包括柳枝稷SBP‑box类转录因子PvSPL1和2的基因克隆和序列测定,然后在此基础上利用嵌合抑制子沉默技术(CRES‑T),抑制整个PvSPL1和2转录因子亚家族的转录活性,从而产生分蘖数目增加的转基因...
SBP-box genes represent transcription factors ubiquitously found in the plant kingdom and recognized as important regulators of many different aspects of plant development. In this study, 15 SBP-box gene family members were identified in tomato and analyzed with respect to their genomic organization ...
Switchgrass (Panicum virgatum L.) is a dedicated lignocellulosic feedstock for bioenergy production. The SQUAMOSA PROMOTER-BINDING PROTEIN (SBP-box)-LIKE transcription factors (SPLs) change plant architecture and vegetative-to-reproductive phase transiti