为验证片段复制对拟南芥和水稻基因组中SBP-box基因家族扩张的作用,本研究采取了两种方式对片段重复加以验证。首先根据TIGR对拟南芥和水稻基因组的注释结果,将所有的SBP-box基因定位于染色体上,并对比已经定义的染色体之间的片段重复(拟南芥基因组的片段复制:http://www.tier.orb/tdb/e2k1/athl/Arabidopsis-genome duplica...
种和亲本上的遗传规律提供参考㊂结果显示:(1)在茶树品种 铁观音 ㊁ 黄棪 ㊁ 舒茶早 和 龙井43 基因组中分别鉴定出21个㊁25个㊁24个和23个S B P 家族基因㊂(2 )系统进化树将其分为8个亚家族,共线性分析发现茶树和拟南芥㊁葡萄的S B P 基因共线性关系与水稻相比更强,同物种内发现 铁观音 与 ...
SBP-box基因家族是植物特有的一个基因家族,广泛存在于绿色植物中,其编码的蛋白被认为是一种转录因子,该转录因子含有一个非常保守的SBP区,这个区域包括一个新的锌指结构和一个核定位信号.研究表明SBP转录因子参与了花的形成及其后期发育,叶的形态建成和环境信号应答等多个生物学过程,在植物的生长和发育中起着重要作用...
利用MEME程序(http://meme.sdsc.edu/meme/intro.html)对拟南芥和水稻SBP-box基因家族成员鉴定保守性基序,除发现的最大基序数目为40外,其余参数为默认。为预测这些保守性基序的功能,对这些序列的一致性序列ScanPROSITE(http://expasy.org/tools/scanprosite/)检索PROSITE数据库中对应的功能性基序。 3. Ka和Ks的计算 ...
1.柳枝稷SBP-box类转录因子PvSPL2的全长CDS,其特征在于:核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。 2.根据权利要求1所述的PvSPL2的全长CDS编码的氨基酸序列,其特征在于:氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。 3.根据权利要求1所述的PvSPL2的核苷酸序列经嵌合抑制子SRDX形成的融合片段PvSPL2-SRDX,其序列如SEQ ID NO.6所示...
SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子,其功能涉及作物遗传改良的许多方面,如产量,株型,抗逆性等,具有重要的实际应用价值.本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolor L.)全基因组中鉴定出18个SBP-box基因,分布于9条染色体上,其中8个基因位于基因组重复区域.系统...
本发明公开了一类柳枝稷SBP‑box类转录因子在增加植物生物量和可发酵糖产量方面的应用,属于植物基因工程技术领域。其主要内容包括柳枝稷SBP‑box类转录因子PvSPL1和2的基因克隆和序列测定,然后在此基础上利用嵌合抑制子沉默技术(CRES‑T),抑制整个PvSPL1和2转录因子亚家族的转录活性,从而产生分蘖数目增加的转基因...
一种水稻SBP-box转录因子基因及其应用 (57)摘要 本发明提供了水稻SBP-box转录因子基因及其应用。本发明具体涉及包含具有SEQIDNO.1核苷酸序列及SEQIDNO.2氨基酸序列;该转录因子的编码序列及包含该编码序列的载体或宿主。本发明还涉及提高植物耐盐性的方法和筛选具有高耐盐性植物的方法。本发明提供了改善和研究植物耐盐...
结果表明大部分甘薯SBP-box蛋白理化性质,结构有一定分化,甘薯SBP-box蛋白与拟南芥同源进化关系较近,不同亚家族间具有不同数量和类型的motif分布;甘薯SBP-box基因在染色体上分布较为均匀,除3条染色体外,其余12条染色体均有1~4个SBP-box基因分布,共线性分析发现甘薯SBP-box基因可能来源于多次片段重复事件;通过启动子...
Switchgrass (Panicum virgatum L.) is a dedicated lignocellulosic feedstock for bioenergy production. The SQUAMOSA PROMOTER-BINDING PROTEIN (SBP-box)-LIKE transcription factors (SPLs) change plant architecture and vegetative-to-reproductive phase transiti