为验证片段复制对拟南芥和水稻基因组中SBP-box基因家族扩张的作用,本研究采取了两种方式对片段重复加以验证。首先根据TIGR对拟南芥和水稻基因组的注释结果,将所有的SBP-box基因定位于染色体上,并对比已经定义的染色体之间的片段重复(拟南芥基因组的片段复制:http://www.tier.orb/tdb/e2k1/athl/Arabidopsis-genome duplica...
比较,通过q R T -P C R 技术分析C s T G Y _S B P 家族成员在不同茶树品种中的表达模式,为探究S B P 基因在茶树杂 种和亲本上的遗传规律提供参考㊂结果显示:(1)在茶树品种 铁观音 ㊁ 黄棪 ㊁ 舒茶早 和 龙井43 基因组中分别鉴定出21个㊁25个㊁24个和23个S B P 家族基因㊂(2 )...
SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子,其功能涉及作物遗传改良的许多方面,如产量,株型,抗逆性等,具有重要的实际应用价值.本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolor L.)全基因组中鉴定出18个SBP-box基因,分布于9条染色体上,其中8个基因位于基因组重复区域.系统...
一种水稻SBP-box转录因子基因及其应用 (57)摘要 本发明提供了水稻SBP-box转录因子基因及其应用。本发明具体涉及包含具有SEQIDNO.1核苷酸序列及SEQIDNO.2氨基酸序列;该转录因子的编码序列及包含该编码序列的载体或宿主。本发明还涉及提高植物耐盐性的方法和筛选具有高耐盐性植物的方法。本发明提供了改善和研究植物耐盐...
SBP家族对月季(Rosa chinensis)开花时间调控和花发育分子机制的研究具有重要意义.对月季SBP-box基因家族进行全基因组鉴定分析,并对该家族潜在负调控因子miR156进行靶基因预测.结果显示,月季SBP-box基因家族包含17个成员,蛋白长度为156~1075 aa.上游顺式元件主要以胁迫,激素响应和光响应为主.其中12个成员是miR156的潜在...
甘薯全基因组SBP-box基因家族鉴定及表达分析. 分子植物育种 10, 1–20. Tripathi RK, Bregitzer P, Singh J (2018). Genome-wide analysis of the SPL/miR156 module and its interaction with the AP2/miR172 unit in barley. Sci Rep 8, 7085. Wang Q, Zhang LY, Xu Y, Li H, Liu SX, Xue ...
本发明公开了一类柳枝稷SBP‑box类转录因子在增加植物生物量和可发酵糖产量方面的应用,属于植物基因工程技术领域。其主要内容包括柳枝稷SBP‑box类转录因子PvSPL1和2的基因克隆和序列测定,然后在此基础上利用嵌合抑制子沉默技术(CRES‑T),抑制整个PvSPL1和2转录因子亚家族的转录活性,从而产生分蘖数目增加的转基因...
SBP蛋白是植物特有转录因子,参与众多生物学过程.尽管在许多植物中SBP家族基因已经被鉴定,但在菜豆中仍然未见报道.本研究为探索菜豆SBP-box基因家族,基于生物信息学手段充分挖掘菜豆基因组和转录组数据资源,鉴定出23个菜豆SBP基因,并系统分析了这些SBP基因的结构、定位、保守基序、表达和系统进化关系.结果表明:2... 查看...
机译:通过5'R快速扩增cDNA(5'RACE),从白桦(Betula platyphylla)获得了代表鳞状启动子结合蛋白盒基因(SBP-box基因)BplSPL2的cDNA,其包含完整的编码序列。序列分析表明,BplSPL2的长度为925 bp,带有一个525 bp的开放阅读框,编码175个氨基酸。通过使用定量实时PCR比较BplSPL2和BplSPL1的表达模式,我们确定前者的表达...
SBP转录因子基因家族是一个植物的特异转录因子家族,SBP基因都含有一段保守的核苷酸序列即DNA结合结构域,又称为SBP盒(SBP-box),SBP盒编码的蛋白质序列称SBP结构域(SBP-domain),含79个氨基酸残基,并具有高度保守性。该研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与大豆基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准,共得...