2022年9月登上Science封面的🔗“Stereo-seq鉴定蝾螈端脑再生过程中的重要神经干细胞亚型”研究中,科研人员依靠SAW软件进行信息提取和分析计算,获得细胞和分子维度信息,进行空间和时间的定位,开展细胞类型注释、基因动态表达和细胞时序变化等一系列分析。最后,利用可靠的分析结果绘制了蝾螈端脑发育及再生的时空单细胞转录组...
SAW是为分析Stereo-seq数据而设计的时空组学生物信息分析流程工具,其通过解析时空芯片测序数据中的空间条形码,还原每个生物分子在组织中的空间定位和表达水平,助力时空组学数据从大数据到有用信息的转化。SAW强大的数据分析和处理的能力,是驱动生命科学深入探索,进而赋能精准医学的重要工具。 0 一、产品亮点 01、支持多组...
在这批工具中，SAW（Stereo-seq Analysis Workflow）尤其受到关注，其作为专门针对时空组学数据处理的工具，致力于快速、准确、可靠地分析时空组学产生的庞大而多维的数据集。SAW工具的强大之处在于其支持对多组学、多模态数据进行高效分析，适用于华大时空组学所有产品线的数据处理需求。它不仅能够灵活处理新鲜...
Stereo-seq Analysis Workflow (SAW) should be run on a Linux system that meets the following requirements: 8-core Intel or AMD processor (>24 cores recommended) 128GB RAM (>256GB recommended) 1TB free disk space or higher 64-bit CentOS/RedHat 7.8 or Ubuntu 20.04 ...
Stereo Pan Modulation Pigments #3 Deep Worm 有肌肉感的心跳声,可塑性比较大,可以加各种效果变成各种常用声音 Additive Synth 反向Ratio 低音区触发与高音区触发效果不同 PolyBrute #1 Western World BladeRunner 兼具BladeRunner高频质感和WesterWorld第三季低频粗粝感的Pad+Lead ...
@@ -17,7 +17,8 @@ Stereo-seq Analysis Workflow (SAW) should be run on a Linux system that meets th * 64-bit CentOS/RedHat 7.8 or Ubuntu 20.04 ### Software * Singularity: a container platform * Docker: a container platform, >=20.10.8 * Singularity: a container platform, >=3.8 *...
Stereo Pan Modulation Pigments #3 Deep Worm 有肌肉感的心跳声,可塑性比较大,可以加各种效果变成各种常用声音 Additive Synth 反向Ratio 低音区触发与高音区触发效果不同 PolyBrute #1 Western World BladeRunner 兼具BladeRunner高频质感和WesterWorld第三季低频粗粝感的Pad+Lead ...
-splitCount : count of split Stereo-seq Chip T Mask file, usually 16 for SE+Q4 FASTQ data and 1 for PE+Q40 FASTQ data -maskFile : Stereo-seq Chip T Mask file path -fq1 : FASTQ file path of read1, if there are more than one FASTQ file, please separate them with comma, e.g:...
SAW是为分析Stereo-seq数据而设计的时空组学生物信息分析流程工具,其通过解析时空芯片测序数据中的空间条形码,还原每个生物分子在组织中的空间定位和表达水平,助力时空组学数据从大数据到有用信息的转化。SAW强大的数据分析和处理的能力,是驱动生命科学深入探索,进而赋能精准医学的重要工具。