Stereo-seq(Spatial Enhanced Resolution Omics-sequencing)作为一种空间转录组学技术,能够以高分辨率在组织切片上捕捉基因表达的空间分布,这对于理解疾病的发生和发展至关重要。通过Stereo-seq,可以在单细胞或细胞群体的水平上绘制出基因表达的空间图谱,从而揭示组织中的细胞异质性、细胞间相互作用以及病理特征的空间分布。
北京时间2024年11月5日，中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所（国家生物信息中心），在Cell上发表研究成果，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，构建了全球首份多器官衰老时空图谱，增强了对衰老生物学机制的理解，找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物，并为进一步探索衰老的...
总之,该研究为Stereo-seq技术在非模式物种中建立部分单细胞水平的高分辨率空间转录组图谱提供了范例,研究成果为进一步研究花生等植物的生物学问题奠定坚实的转录组学策略。 图2. 花生组织的空间转录组图谱 3. 整合单核和空间转录组学捕捉大豆根瘤成熟的过渡状态 期刊:Nature plants 影响因子:15.8 发表时间:2023年4月1...
北京时间2024年11月5日,中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所(国家生物信息中心),在Cell上发表研究成果,利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,构建了全球首份多器官衰老时空图谱,增强了对衰老生物学机制的理解,找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物,并为进一步探索衰老的干预策略...
Stereo-seq*是华大自主研发的时空转录技术,该技术基于DNA纳米球(DNA Nano Ball,DNB)开发,具有高通量、超高分辨率、大视场的原位全景式技术、可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空间转录分析。该技术通过时空芯片捕获组织中的mRNA,并...
本次大会上,廖莎从通用性和引领性两方面重磅发布了Stereo-seq的技术突破和新品体验计划。 ►►► 通用性 在通用性方面,华大时空从样本和操作性出发,提升Stereo-seq技术的可及性。 样本可及性 在样本可及性上,Stereo-seq实现了将在液氮或-80℃...
从信息维度层面,Stereo-seq可以在延续单细胞测序分析逻辑的同时加入空间坐标维度,能够实现整体和局部空间区域内多种细胞个体及个体之间的关联信息的解读。然而,空间组学的分子检测不以细胞为基本单元,空间转录组数据必须借助算法来生成细胞意义上的转录组信息。华大自主研发的基于Stereo-seq系列的CellBin一站式细胞分割方案...
近日，中国科协生命科学学会联合体公布了2024年度“中国生命科学十大进展”，基于华大时空组学技术Stereo-seq等技术完成的研究成果——“衰老的时空编程及干预”入选，彰显了华大在生命科学领域的技术创新实力与科研攻关能力。中国科协生命科学学会联合体自2015年起开展年度“中国生命科学十大进展”评选工作，旨在推动生命科学...
4月11日,武汉华大生命科学研究院联合华大生命科学研究院基因组多维解析技术全国重点实验室、南方科技大学等单位,利用华大自主研发的单细胞组学技术DNBelab C4和时空组学技术Stereo-seq,在单细胞水平上成功解密了拟南芥叶片衰老的过程,相关研究成果发表于国际顶级学术期刊《细胞》(Cell)。
Stereo-seq技术是一种结合先进测序和成像技术的创新方法，旨在深入研究空间转录组学。以下是Stereo-seq的主要实施步骤及其背后的科学原理：核心步骤概览：组织样本制备：从目标组织切取薄片，通常选择厚度为10微米的冰冻切片。DNA Nanoball (DNB)构建：合成包含多个功能域的DNA寡核苷酸，这些域包括随机条形码序列、坐标标识...