view命令中,对sam文件头部的输入(-t或-T)和输出(-h)是单独的一些参数来控制的。 Usage: samtools view [options]<in.bam>|<in.sam>[region1 [...]] 默认情况下不加 region,则是输出所有的 region. Options: -boutput BAM 默认下输出是 SAM 格式文件,该参数设置输出 BAM 格式 -hprint header for the...
samtools view [options] <in.bam>|<in.sam>|<in.cram> [region ...] 参数介绍: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制Cloud Studio 代码运行 # samtools view 使用说明: -b output BAM 默认下输出是 SAM 格式文件,该参数设置输出 BAM 格式-h print header for the SAM output 默认下输出的 sam 格式...
Usage: samtools tview [options] <aln.bam> [ref.fasta] Options: -d display output as (H)tml or (C)urses or (T)ext -p chr:pos go directly to this position -s STR display only reads from this sample or group --input-fmt-option OPT[=VAL] Specify a single input file format option...
view命令中,对sam文件头部的输入(-t或-T)和输出(-h)是单独的一些参数来控制的。 Usage: samtools view [options] <in.bam>|<in.sam> [region1 [...]] 默认情况下不加 region,则是输出所有的 region. Options: -b output BAM 默认下输出是 SAM 格式文件,该参数设置输出 BAM 格式 -h print header f...
samtools: view samtools view [options] input.file input.file: 可以是sam、bam、或者其他相关格式,输入文件的格式会被自动检测 默认输出内容为文件的record部分 默认输出到标准输出 options: -b: 输出为bam格式,默认输出为sam格式 -h: 连同header一起输出,默认是不输出header的...
samtools view是一个用于查看和过滤SAM/BAM文件的命令行工具。它可以根据不同的选项来选择性地查看和提取SAM/BAM文件中的reads。 基本的用法是: ``` samtools view [options] ``` 其中,``是要查看的SAM/BAM文件的路径。 常用的选项包括: - `-b`:将输出格式设置为BAM格式。 - `-h`:输出文件中包含头部...
view命令中,对sam文件头部的输入(-t或-T)和输出(-h)是单独的一些参数来控制的。 Usage: samtools view [options] <in.bam>|<in.sam> [region1 [...]] 默认情况下不加 region,则是输出所有的 region. Options: -b output BAM 默认下输出是 SAM 格式文件,该参数设置输出 BAM 格式 ...
view命令中,对sam文件头部的输入(-t或-T)和输出(-h)是单独的一些参数来控制的。 Usage: samtools view [options] <in.bam>|<in.sam> [region1 [...]] 默认情况下不加 region,则是输出所有的 region. Options: -b output BAM 默认下输出是 SAM 格式文件,该参数设置输出 BAM 格式 ...
view命令中,对sam文件头部的输入(-t或-T)和输出(-h)是单独的一些参数来控制的。 Usage: samtools view [options] <in.bam>|<in.sam> [region1 [...]] 默认情况下不加 region,则是输出所有的 region. Options: -b output BAM 默认下输出是 SAM 格式文件,该参数设置输出 BAM 格式 ...
view命令中,对sam文件头部的输入(-t或-T)和输出(-h)是单独的一些参数来控制的。 Usage: samtools view [options]|[region1 [...]] 默认情况下不加 region,则是输出所有的 region. Options: -b output BAM 默认下输出是 SAM 格式文件,该参数设置输出 BAM 格式 ...