不需要编译,下载完成后直接使用: wget https://github.com/biod/sambamba/releases/download/v0.8.2/sambamba-0.8.2-linux-amd64-static.gz gunzip sambamba-0.8.2-linux-amd64-static.gz mv sambamba-0.8.2-linux-amd64-static sambamba ./sambamba --help #检查是否可运行 echo "export PATH=`pwd`:$PATH...
使用sambamba操作bam文件和去除重复,该命令运行比picard MarkDuplicates快30倍。 安装 # conda (高效版)#codna create -n wes #先创建小环境,如果已经创建,可以忽略conda activate wes conda install-y sambamba# 预编译的二进制版安装(简单版)wget-c https://github.com/biod/sambamba/releases/download/v1.0.1...
sambamba:比对结果去重软件软件链接: https://github.com/biod/sambamba/releases去该链接下载你所需要的版本,以sambamba 0.8.1为例 #建个文件夹 mkdir sambamba.0.8.1 #将刚才下载的包移入刚才建好的文件夹下 m…
5.echo$PATH#查看已加入PATH中的路径(shell将到哪些目录中寻找命令或程序,PATH的值是一系列目录,当您运行一个程序时,Linux在这些目录下进行搜寻编译链接)然后1)可以把软件链接到已有路径下 2)把软件路径加入$PATH6.这里,把软件链接到已有$PATH下的路径,ln-s /opt/bin/olympus_tools/sambamba/sambamba /usr/loca...
sambamba的安装 灵动的小猪关注赞赏支持sambamba的安装 灵动的小猪关注IP属地: 广东 0.2172019.03.24 22:09:41字数44阅读5,027 下载文件wget -c https://github.com/biod/sambamba/archive/v0.6.9.tar.gz tar -zxvf sambamba-0.6.9.tar.gz cd sambamba make 这个时候可能会报错...