2,将所需数据从GEO数据库下载之后,如何将数据导入R语言中?3,采用R语言进行差异基因表达分析时需要用...
第二代功能富集分析方法则可以很好弥补第一代方法的不足,最有代表性的方法就是GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)的方法。以GSEA为例,分析也可以分为两步: (a)利用某个指标(例如差异倍数)对所有基因进行排序(而不是用固定阈值筛选)。 (b)判断某个通路的基因在所有的排序中是否更为靠前(或靠后),来证明实验...
8.分组的时候自己进行组别命名,命完名之后,单击每个样本,再单击分组的名字就可以把这个样本分到对应的组别里面了。 8.分完组之后,点击下方的Analyze,进行数据分析。 9.数据分析完之后,页面会自动跳转到基因表达的界面,从界面我们可以看出来,里面有不同基因的表达量,基因的名称等信息。 10.选择Profile graph这一栏,...
2,将所需数据从GEO数据库下载之后,如何将数据导入R语言中?3,采用R语言进行差异基因表达分析时需要用...