图2 基于RNA-Seq数据所做的基因集富集分析 3. 时序分析 是指对相同样本在一个时间段的不同时间点的基因表达水平进行测量,以观测该样本在各个时间点的基因表达变化情况,并藉此开展相关分析。 通过时序分析,可以探讨该样品在这个时间段内的多个时间点的基因表达模式,继而对某个表达模式的基因进行GO和KEGG的功能类富集...
而RNA小精灵们也很高兴,因为它们知道自己的重要使命得到了认可和理解。 这就是RNA转录组测序的神奇故事。它不仅仅是一种科学技术,更像是一种魔法,让我们能够听到生命中微小却重要的声音。 好了,现在该睡觉了。 亲爱的读者,我们的旅程就到这里结束了。通过这次旅行,您不仅学到了如何处理RNA-Seq数据,而且还窥探到...
本书全面介绍了RNA-seq数据分析的基本原理和方法，内容涵盖数据分析的整个工作流程，包括质量控制、作图、组装、统计检验和代谢途径分析等。书中在进行理论讲解的同时，还使用了较多实例，不仅生物信息学家，甚至没有相关分析经验的研究人员也均可参照这些实例进行分析。图书目录 第1章RNA－seq简介 第2章RNA－seq数据...
单细胞转录组RNAseq测序是什么? 在传统的测序技术中,上机测序的样本是由多个细胞构成的,分析得出的结论也只是基于所有细胞的平均水平,但是我们知道细胞是具有异质性的,对于大脑等复杂组织而言,其细胞类型是多样的;对于肿瘤细胞而言,其细胞异质性更是尤为突出,为了克服细胞异质性的影响,提高科学研究的精度,科学家在不...
《基于标准样品的Microarray与RNA-seq噪声分析与消除》是依托复旦大学，由郁颖担任项目负责人的青年科学基金项目。项目摘要 表达谱芯片（Microarray）和转录组测序（RNA-seq）技术是基因表达检测的重要手段，但在实验设计、生物样品采集、RNA提取、文库构建方案、高通量测序平台、数据分析、实验室等方面容易引入误差，在数据...
你准备一个分组文件，像课程一样做成两列，第一列为样本，第二列为分组，其他不相干的样本删除；
《基于RNA-seq技术的中药巴戟天转录组分析和分子标记挖掘》是依托深圳大学，由王西亮担任项目负责人的青年科学基金项目。项目摘要 巴戟天以根入药，为我国四大南药之一，是重要的传统中药材，具有补肾壮阳、增强免疫力和抗抑郁等多种功效。目前对巴戟天的研究主要集中于药理功能、化学成分等方面。基因水平的研究却...
可用于做差异分析，因为做差异分析的软件要求输入原始reads数；例如DESeq2等等；