而RNA小精灵们也很高兴,因为它们知道自己的重要使命得到了认可和理解。 这就是RNA转录组测序的神奇故事。它不仅仅是一种科学技术,更像是一种魔法,让我们能够听到生命中微小却重要的声音。 好了,现在该睡觉了。 亲爱的读者,我们的旅程就到这里结束了。通过这次旅行,您不仅学到了如何处理RNA-Seq数据,而且还窥探到了玉米这个神秘生物的生命密码。 记得,科学就像一场冒险,总有更多未知等...
图2 基于RNA-Seq数据所做的基因集富集分析 3. 时序分析 是指对相同样本在一个时间段的不同时间点的基因表达水平进行测量,以观测该样本在各个时间点的基因表达变化情况,并藉此开展相关分析。 通过时序分析,可以探讨该样品在这个时间段内的多个时间点的基因表达模式,继而对某个表达模式的基因进行GO和KEGG的功能类富集...
你准备一个分组文件，像课程一样做成两列，第一列为样本，第二列为分组，其他不相干的样本删除；
可用于做差异分析，因为做差异分析的软件要求输入原始reads数；例如DESeq2等等；
这就是RNA转录组测序的神奇故事。它不仅仅是一种科学技术,更像是一种魔法,让我们能够听到生命中微小却重要的声音。 好了,现在该睡觉了。 亲爱的读者,我们的旅程就到这里结束了。通过这次旅行,您不仅学到了如何处理RNA-Seq数据,而且还窥探到了玉米这个神秘生物的生命密码。
我们的旅程从获取测序数据开始。假设你已经从高通量测序平台获得了玉米的RNA-Seq数据。 通常,这些数据以FASTQ格式呈现,包含大量的短序列读取。 数据清洗:去除噪音 首先,我们需要用Trimmomatic等工具清洗数据。 为什么呢?因为原始数据中可能夹杂着适配器序列和低质量读取。以下是一个示例代码: ...
脂肪组织RNA-seq结果组内差异大，可能由多种生物学和技术因素造成。通过仔细排查和优化实验设计与分析方法...