非链特异性 默认,不需要设置 链特异性 参数为:—SS_lib_type ,如果使用dUTP,值为 RF 1.2 cufflinks 非链特异性 —library-type fr-unstranded, 默认 链特异性 如果使用dUTP:—library-type fr-firststrand 2. 将 reads 比对到基因组的软件 2.1 tophat 非链特异性 —library-type fr-unstranded, 默认 链...
由上述数据表明,该SMART-Seq试剂盒具有1-1,000个细胞的稳定建库性能。 SMART-Seq可以实现与SMART-Seq v4相当的灵敏度和再现性! 通过FACS分离的K562单细胞,使用SMART-Seq试剂盒与单细胞RNA-seq试剂盒SMART-Seq v4 Ultra(合成cDNA用Nextera®XT DNA制备文库)进行了文库制备,然后进行NGS测序分析。 Panel A 每个试...
为明确植物病原真菌禾谷镰刀菌Fusarium graminearum全生活史的转录组特征和基因表达模式,采用生物信息学技术对其生活史不同阶段15个时期或组织的链特异性RNA-seq数据进行分析.结果表明,共有8106个基因在所有时期均有表达,为禾谷镰刀菌生活史核心基因,占总基因数的47.2%;有性生殖和侵染过程中表达的基因数相对较多,其中...