目前链特异性文库的建库方法有很多种,主要分为2类。第一类是在RNA的3’和5’端加上不同的接头,2个不同的接头序列标记RNA的3’和5’端(图1A)。第二类依赖于化学修饰标记一条链,使得碱基发生变化或链被降解(图1B)。不同RNA样本如何构建链特异性文库 1 小RNA属于非编码核糖核酸(ncRNA),在基因调控中...
一、非特异性建库过程 反转录为单链cDNA,DNA聚合酶合成另一条链cDNA,得到双链的cDNA,然后纯化富集为cDNA文库 末端加A碱基,使得平末端转换为粘性末端,便于后续加引物和接头 片段大小选择 二、链特异性建库过程 谨记:dUTP链特异性建库属于RF 反转录为单链cDNA 在合成第二条链时,用dUTP代替dTTP,因此第二条DNA链上...
SMARTer Stranded RNA-Seq Kit用于构建illumina平台链特异性转录组文库,链特异性的转录组比率>99%.这款试剂盒的建库起始量为100pg到100ng的RNA。SMARTer Stranded RNA-Seq Kit采用的是随机引物的方法进行反转录,这种方法既可以使用ploy A RNA进行建库,也可以采用rRNA-removed total RNA 进行建库。