转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
首先是测序得到的fastq文件,通过和参考序列的比对和表达定量,生成原始的定量结果(如下图所示)。最左列是基因名,最上列是不同细胞系/不同处理的名称,中间的数字就是对测序结果的定量值(绝对定量)。 2.数据标准化。 DESeq2将对原始reads进行建模,使用标准化因子(scale factor/size factor)来解释库深度的差异。然后...
一、RNA-seq原理 RNA-seq的原理基于测序技术,通过将RNA样本转录成cDNA,然后进行高通量测序,最后利用计算方法分析测序结果。具体步骤如下: 1. RNA提取:从细胞或组织中提取总RNA,包括mRNA、rRNA、tRNA等各种类型。 2. RNA片段化:将提取的RNA进行片段化处理,通常采用酶或碱性水解等方法。 3. cDNA合成:利用反转录酶...
RNA-seq测序,也就是转录组测序,它的原理主要是利用高通量测序技术,对生物体内所有的转录产物进行测序分析。这个过程包括了从样本中提取总RNA,然后构建测序文库,最后进行测序和数据分析。在数据分析阶段,我们会把测序得到的原始读长进行过滤、组装,并进行生物信息学分析,从而得到基因的表达水平等信息。简单来说,就是通过...
PCR原理 步骤3 因为II代测序(NGS)的illumina测序不能测很长的seq,约为200-700bp,所以不能测得mRNA全长,因此需要进一步把合成的cDNA利用酶打断到illumina能测的长度(长度有些随机,比如300bp的cDNA能通过头尾150bp完整测序,但700bp的cDNA只能通过头尾150bp测序+参考基因组推断出来)。然后在cDNA的3'端插入Truseq Re...
RNA-Seq是一种基于高通量测序技术的转录组学研究方法,通过对生物样品中所有RNA分子进行测序,从而获得基因表达的全面信息。今天,我们来详细讲解RNA-Seq的原理和应用。🔍 什么是RNA-Seq? RNA-Seq,即RNA测序技术,也称为转录组测序技术,是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、...
rna seq原理 RNA-Seq是一种高通量测序技术,用于分析和揭示细胞和组织中存在的RNA分子的种类和量。它通过将RNA分子转化为可逆转录的DNA(cDNA),然后使用高通量测序技术对cDNA进行测序。 RNA-Seq的工作流程如下:首先,从细胞或组织中提取RNA分子,并对RNA进行纯化和酶解,以去除可能存在的DNA和蛋白质污染物。接下来,...
rna-seq原理 RNA-seq(RNA序列)是一种用于检测和测量转录组中的RNA分子数量和种类的高通量测序技术。与传统的微阵列技术相比,RNA-seq能够提供更高的分辨率和更广泛的检测范围,因此已成为了转录组学研究的常用技术之一、RNA-seq的原理基于第二代测序技术,包括Illumina HiSeq、Ion Torrent PGM和Roche 454等。 RNA-...
rna-seq基本原理 RNA-seq(RNA测序)是一种通过测定RNA分子在特定条件下的表达水平来研究基因表达的技术。其基本原理如下: 1. RNA提取:首先从生物样品中提取总RNA,包括所有转录本的mRNA、rRNA和tRNA等。RNA提取的方法可以根据研究目的和样品的特性选择合适的方法。 2. RNA逆转录:将提取的总RNA经过逆转录反应,将RNA...