一、不同平台 RNAseq 研究的比较 在前面介绍过不同测序平台的优势,目前市场上主流测序平台主要包括短读长测序的 illumina 测序平台,华大基因的 MGI 测序平台,长度长测序的 Pacbio 测序以及牛津纳米孔 nanopore 测序。在 ncbi 的 sra数据库中,目前超过 95%的的数据均来自于 illumina 测序,这一方面是由于 illumina ...
标准(Standard)、链特异性(Strand-Specific)、单细胞(Single-Cell)、小型(Small)和超低输入(Ultra-Low Input)RNA-Seq在Illumina平台上使用短读测序,例如NovaSeq和HiSeq。Iso-Seq在PacBio Sequel上使用长读测序。 相关服务: 多组学整合分析 提交需求 姓名* ...
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性...
MGISEQ-2000测序平台为单细胞测序提供通量适配、兼容性高、经济且质量高的产品选择,目前MGISEQ-2000已在上海交通大学、北京大学、中科院广州生物医药与健康研究院、首都医科大学附属北京世纪坛医院等等,众多科研院校、医院科研部门及生物企业开展单细胞测序,助力更深入的单细胞研究。 成立于2019年,旨在建设先进实验室和开发...
简介Bulk RNA-seq是目前普遍应用于转录组研究的技术手段。为满足同学们在科研方面的需求,并针对普遍存在的问题,基因测序与分析平台现举办Bulk RNA-seq数据分析培训。欢迎同学们报名参加。 培训内容:1. Bulk RNA-seq实验设计;2. Bulk RN...
单细胞染色质可及性分析(single cell ATAC-seq,scATAC-seq)和单细胞转录组(single cell RNA-seq,scRNA-seq)测序是单细胞多组学中应用最广泛的两个组学技术。主流的微流控体系和微孔板体系为高通量的单细胞或单细胞核分离提供了有效的方案。但微流控平台的封闭特性使得单细胞分隔之后很难再对其进行多步加样或其他...
德国萨尔兰大学的研究人员利用华大基因的BGISEQ-500进行microRNA测序,并将其测序性能与芯片和Illumina HiSeq测序仪的性能进行比较,研究结果发表在《Clinical Epigenetics》杂志上。 萨尔兰大学临床生物信息学主管Andreas Keller表示,他的实验室主要研究...
有的说是24M，这都是指通量吗？怎么差距这么大？而且有些似乎分不清RNA-seq和全基因组测序啊......
转录组测序(RNA-Seq)完成后，大家在筛选差异基因时，求助：FDR值是用的几？期待您的回复，本人QQ：...
近期,两项独立研究成果表明,MGI测序平台与Illumina测序平台产生的单细胞RNA数据质量相当,且从目前已知的价格来看,华大智造测序平台的测序成本则更具优势。 其中,一项研究由澳大利亚加文医学研究所(Garvan Institute of Medical Research)与华大研究人员合作完成。研究团队利用10x Genomics平台处理单细胞,并在MGISEQ-2000和Ne...