RNA-seq(RNA sequencing)即转录组测序技术,就是用高通量测序技术进行测序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。 在过去的十年中,RNA-Seq技术迅速发展,并成为了在转录组水平上分析差异基因表达/mRNA可变剪切的不可缺少的工具。随着下一代测序技术的发展,RNA-Seq技术应用范围变得更加广泛:一...
转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
short-read RNA-seq结果很稳定,对RNA-seq的short-read测序技术多次测试比较发现,其平台内和平台间的相关性都很好。然而在样本准备和计算分析阶段有一些步骤也会引入偏好性。这些限制会影响特定生物问题的解释,比如正确地识别和定量一个基因的多个转录异构体。这一局限与研究特别长或特别多变的转录异构体尤其相关。如...
RNA-Seq是一种基于高通量测序技术的转录组学研究方法,通过对生物样品中所有RNA分子进行测序,从而获得基因表达的全面信息。今天,我们来详细讲解RNA-Seq的原理和应用。🔍 什么是RNA-Seq? RNA-Seq,即RNA测序技术,也称为转录组测序技术,是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、...
一般来说,NGS测序特别是RNA-seq正在迅速改变实验的设计和执行方式。由于技术的飞速发展,可以公平地说,对于一个特定问题没有单一的正确答案。而且许多RNA-seq项目有多个目标,例如,可能需要鉴定样本中的新基因融合转录物,对已知基因的丰度进行量化,并鉴定已知基因中的任何SNP...
第一代测序技术（Sanger Method）第一代测序技术由Fred Sanger提出，被称为Sanger Method，是分子测序领域“从无到有”的重大突破。此方法基于常规的PCR技术以及特殊的原料ddNTP（双脱氧核苷三磷酸）。在PCR扩增时，四种ddNTP分别被加入体系中，由于ddNTP缺少3’-OH基团，不具备形成磷酸二酯键的能力，理论上可以终止在...
近期Oxford Nanopore展示他们的纳米孔测序技术能直接测序RNA,也就是说,建库过程中没有修复、cDNA合成、PCR扩增这些过程,移除了这些操作过程的偏好并且保留了RNA上的表观修饰信息,这一技术也称为dRNA-seq。直接从RNA建库需要两步接头连接。首先,带有oligo(dT)悬臂的duplex adaptor与mRNA的PolyA尾巴退火连接。后续是一个...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
采用Ion Torrent NGS 技术进行的RNA测序 从靶向基因表达分析到全转录组测序,Ion Torrent™ 产品将简单的样品制备与直观的数据分析相结合,最终实现完整的 RNA 测序方案。 靶向转录组测序 靶向测序方法着重于 >20,000 种已知基因,这是对于全转录组测序非常了不起的折衷方案,因为分析被极大地简化了 ...