转录组测序(RNA-Seq,RNA sequencing)是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物(包括mRNA、非编码RNA等)进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络,是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
RNA-Seq,即RNA测序技术,也称为转录组测序技术,是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、微RNA(miRNA)和非编码RNA(ncRNA),用高通量测序技术进行测序分析,反映出它们的表达水平。🚀 高通量测序技术 高通量测序技术(High-throughput sequencing),也称为“下一代”测序技术(Next...
Ion AmpliSeq 转录组解决方案 Ion Proton 系统 Ion GeneStudio S5 系列测序仪 采用Ion Torrent NGS 技术进行的RNA测序 从靶向基因表达分析到全转录组测序,Ion Torrent™ 产品将简单的样品制备与直观的数据分析相结合,最终实现完整的 RNA 测序方案。 靶向转录组测序 ...
RNA-seq实验流程图 1. RNA样品检测 采用分子生物学先进设备检测RNA样品的纯度、浓度和完整性,以保障使用合格的样品进行转录组测序。 2.RNA文库构建 样品检测合格后,进行文库构建,主要流程如下: (1) 用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA; (2) 加入Fragmentation Buffer将mRNA进行随机打断; ...
而RNA-seq技术则是近年来兴起的一种高通量测序技术,逐渐替代了传统的microarray技术,成为了研究转录组学的主流方法之一。 二、RNA-seq的原理 1. 测序库构建 在进行RNA-seq实验之前,首先需要构建测序库。通常采用聚合酶链式反应(PCR)或者DNA和RNA的逆转录(Reverse Transcription)来将RNA转录成双链DNA,并添加barcode...
转录组测序(RNA-Seq)的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。新一代高通量测序技术能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。
第三代测序技术(Long Read RNA-seq)由于Illumina测序前需要事先将样本链打碎,测序后通过软件去还原完整的序列,而且单次读长限制在200bp以内,在做全转录组分析时可能会丢失相当一部分信息,而第三代测序技术恰恰弥补了这一短板。第三代技术有两种:1)单分子实时测序技术(SingleMolecular Real-Time Sequencing,...
突破科研瓶颈,适合少量珍贵样本的转录组测序 RNA-seq(RNA测序)技术已经成为探索疾病机制、开发药物以及个性化治疗的重要工具。然而传统RNA-seq技术对样本数量的要求较高,对于量极少的珍贵临床样本如组织、血液或细胞培养物常常面临样本量不足...
RNA-seq技术的广泛应用为转录组研究迎来了一个新时代。根据研究内容的方向,精度、速度和成本要求不同,科研人员需要对包括采取何种具体测序方法流程、样品类型、所需的分析结果,以及基因组研究现状和计算数据处理可用资源等内容进行权衡。因为涉及的问题复杂多样,如何找到一种...