转录组测序(RNA-Seq,RNA sequencing)是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物(包括mRNA、非编码RNA等)进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络,是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
RNA-seq,RNA-seq(RNA sequencing)即转录组测序技术,就是用高通量测序技术进行测序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。在过去的十年中,RNA-Seq技术迅速发展,并成为了在转录组水平上分析差异基因表达/mRNA可变剪切的不可缺少的工具。随着
而RNA-seq技术则是近年来兴起的一种高通量测序技术,逐渐替代了传统的microarray技术,成为了研究转录组学的主流方法之一。 二、RNA-seq的原理 1. 测序库构建 在进行RNA-seq实验之前,首先需要构建测序库。通常采用聚合酶链式反应(PCR)或者DNA和RNA的逆转录(Reverse Transcription)来将RNA转录成双链DNA,并添加barcode...
(RNA-Seq)的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。新一代高通量测序技术能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。
RNA-Seq是一种基于高通量测序技术的转录组学研究方法,通过对生物样品中所有RNA分子进行测序,从而获得基因表达的全面信息。今天,我们来详细讲解RNA-Seq的原理和应用。🔍 什么是RNA-Seq? RNA-Seq,即RNA测序技术,也称为转录组测序技术,是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、...
RNA-seq实验流程图 1. RNA样品检测 采用分子生物学先进设备检测RNA样品的纯度、浓度和完整性,以保障使用合格的样品进行转录组测序。 2. RNA文库构建 样品检测合格后,进行文库构建,主要流程如下: (1) 用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA; (2) 加入Fragmentation Buffer将mRNA进行随机打断; ...
第三代测序技术(Long Read RNA-seq)由于Illumina测序前需要事先将样本链打碎,测序后通过软件去还原完整的序列,而且单次读长限制在200bp以内,在做全转录组分析时可能会丢失相当一部分信息,而第三代测序技术恰恰弥补了这一短板。第三代技术有两种:1)单分子实时测序技术(SingleMolecular Real-Time Sequencing,...
突破科研瓶颈,适合少量珍贵样本的转录组测序 RNA-seq(RNA测序)技术已经成为探索疾病机制、开发药物以及个性化治疗的重要工具。然而传统RNA-seq技术对样本数量的要求较高,对于量极少的珍贵临床样本如组织、血液或细胞培养物常常面临样本量不足...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...