转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
RNA-seq,RNA-seq(RNA sequencing)即转录组测序技术,就是用高通量测序技术进行测序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。在过去的十年中,RNA-Seq技术迅速发展,并成为了在转录组水平上分析差异基因表达/mRNA可变剪切的不可缺少的工具。随着
而RNA-seq技术则是近年来兴起的一种高通量测序技术,逐渐替代了传统的microarray技术,成为了研究转录组学的主流方法之一。 二、RNA-seq的原理 1. 测序库构建 在进行RNA-seq实验之前,首先需要构建测序库。通常采用聚合酶链式反应(PCR)或者DNA和RNA的逆转录(Reverse Transcription)来将RNA转录成双链DNA,并添加barcode...
小RNA测序将最先进的 Invitrogen™ RNA 技术与全转录组测序方法相结合,专注于细胞的小RNA含量检测 全转录组测序此方法也被称为 RNAseq,具有最大的发现潜力,但是也会带来最大的生物信息学挑战全转录组测序 (RNAseq) 链特异性、无偏好的全转录组分析使得能够鉴定和定量分析已知和新型转录本。将 Ion S5™ 系统...
第三代测序技术（Long Read RNA-seq）由于Illumina测序前需要事先将样本链打碎，测序后通过软件去还原完整的序列，而且单次读长限制在200bp以内，在做全转录组分析时可能会丢失相当一部分信息，而第三代测序技术恰恰弥补了这一短板。第三代技术有两种：1）单分子实时测序技术（SingleMolecular Real-Time Sequencing，...
RNA-seq实验流程图 1. RNA样品检测 采用分子生物学先进设备检测RNA样品的纯度、浓度和完整性,以保障使用合格的样品进行转录组测序。 2. RNA文库构建 样品检测合格后,进行文库构建,主要流程如下: (1) 用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA; (2) 加入Fragmentation Buffer将mRNA进行随机打断; ...
RNA测序技术简介 RNA测序(RNA-seq)是转录组学研究的重要工具,也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性,转录组学有以下优势:1)能够动态考察细胞基因组的表达,多维度地反映差异变化;2)可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA,研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用;3)与...
RNA-seq技术的广泛应用为转录组研究迎来了一个新时代。根据研究内容的方向,精度、速度和成本要求不同,科研人员需要对包括采取何种具体测序方法流程、样品类型、所需的分析结果,以及基因组研究现状和计算数据处理可用资源等内容进行权衡。因为涉及的问题复杂多样,如何找到一种...
RNA-seq即转录组测序技术(Transcriptome sequencing),广义的定义为:对细胞内所有RNA(包括rRNA/ tRNA/ mRNA等)进行高通量测序,狭义的定义为:对细胞内mRNA进行高通量测序,临床检验实验室指的一般为狭义的转录组测序。 融合基因 融合基因(Fusion genes , FG)是...