转录组测序RNA-Seq是基于二代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集,然后反转录为 cDNA后进行的高通量测序,在此基础上进行片段的拼接组装,从而可得到一个个的转录本,进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行...
转录组学(Transcriptomics)是使用高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下RNA序列信息,并对其结构和表达信息进行分析。可用于预测基因结构、可变剪切和其他转录修饰,并可定量测定每个转录本在生长过程中和不同条件下表达水平的变化。 (Schematics of RNA-Seq workflow. Wang Y et al.,...
3、测序策略:HiSeq PE150 RNA测序分析研究案例:从测序到投Nature旗下期刊文章3个月 研究人员培养并工程化改造了牛角膜内皮细胞,使其发生上皮-间质转化,并研究该过程中细胞内各通路的变化,确定其机制,其中最关键的一步就是对样品进行转录组测序。然而因牛育种过程不同使得个体差异大,且注释不完善,属于典型的非模式...
RNA结合蛋白免疫共沉淀测序技术(RIP-Seq)是研究细胞内RNA与其结合蛋白情况,了解转录后调控网络动态过程的前沿技术。其主要是利用针对特定蛋白的抗体对对应的RNA-蛋白质复合物进行沉淀,再分离复合物后提取结合在复合物上的RNA,并对其进行测序,分析和验证。RIP-Seq可用来了解不同样品中与特定蛋白结合RNA的整体水平,探究结...
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外泌体small RNA测序 外泌体(Exosome)是由细胞分泌而来的微小囊泡,直径约为30-100 nm,具有杯状形态、双层膜结构,天然存在于血液、尿液、唾液、母乳和细胞培养基等生物体液中。包括肿瘤细胞在内几乎所有类型的细胞(免疫细胞、神经细胞、干细胞),都可以产生并释放exosome。Exosome可通过细胞膜受体直接激活受体细胞,也...
转录组(Transcriptome)是指一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。转录组学(Transcriptomics)是使用高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下RNA序列信息,并对其结构和表达信息进行分析。可用于预测基因结构、可变剪切和其他转录修饰,并可定量测定每个转录本在...