高分辨率测序技术,如RNA-Seq产生的数据,可以当做表达变化及其模式的标本。利用从NCBI SRA 的RNA-Seq数据公共库找到的人类前列腺肿瘤样本数据,我们运用了CLC Genome Workbench对病人样本和正常患者的样本进行的基因表达变化分析。为了阐明其变化的生物学过程,我们采用了利用人工筛选的生物信息数据库的IPA®软件进行相关的...
直接对RNA进行测序), 然后将cDNA 文库中的 DNA 随机剪切为小片段(或先将RNA片段化后再反转录), 在cDNA两端加上接头利用新一代高通量测序仪测序, 直到获得足够的序列, 所得序列通过比对(有参考基因组)或从头组装(de novo assem- bling)(无参考基因组)形成全基因组范围的转录谱。
现阶段,利用高通量测序技术进行lncRNA测序,并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析,有助于科研工作者更快发现那些具有重要调控功能的lncRNA,分析其与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA序列以及位置信息,且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制,还可对新的lncRNA进行预测及功能分析,极大促进...
高分辨率测序技术,如RNA-Seq产生的数据,可以当做表达变化及其模式的标本。利用从NCBI SRA 的RNA-Seq数据公共库找到的人类前列腺肿瘤样本数据,我们运用了CLC Genome Workbench对病人样本和正常患者的样本进行的基因表达变化分析。为了阐明其变化的生物学过程,我们采用了利用人工筛选的生物信息数据库的IPA®软件进行相关的...
RNA-seq 转录组测序 与cfDNA体细胞突变检测相比,基因表达相关的RNA-seq转录组测序在常规的mRNA、非编码RNA (lncRNA、circRNA、microRNA/piRNA等)以及肿瘤融合基因鉴定方面应用较为成熟,业内价格透明且相当低廉。但不少转化医学项目往往选择传统的polyA富集建库,只拿到mRNA数据而丢掉了其它非编码RNA信息(常规的mRNA甚至...
原来不用繁琐得安装调试Linux系统,在Windows下就能快速分析二代测序转录组数据。Rsubread就能实现此功能。说明书里面的图很直观,直接上图了(图来源https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/Rsubread/inst/doc/SubreadUsersGuide.pdf) 种子和投票原理 ...
刷刷题APP(shuashuati.com)是专业的大学生刷题搜题拍题答疑工具,刷刷题提供RNA-seq是基于高通量二代测序技术的转录组学研究方法。A.正确B.错误的答案解析,刷刷题为用户提供专业的考试题库练习。一分钟将考试题Word文档/Excel文档/PDF文档转化为在线题库,制作自己的电子错
生物信息学:二代测序数据的基础分析 6.RNA-seq实操,是爱奇艺教育类高清视频,于20210824上映。内容简介:特邀科研团队,该团队从事分子生物实验工作,有丰富的科研经验,掌握各种分子生物学实验原理与操作方法。主讲医名博士,湘雅医学院病理学博士,具有7年分子生物学,
TIANSeq Fast RNA Library Kit (Illumina) 是针对Illumina高通量测序平台开发的非定向转录组文库构建专用试剂盒,可用于常规转录组分析及lncRNA等非编码RNA的分析。本试剂盒采用快速一管式的操作流程,可对RNA样本进行快速文库构建,在双链cDNA合成后,样本的末端修复和dA尾添加一步完成,所得产物无需纯化即可直接用于接头...
TIANSeq RNA纯化磁珠是一款可以用于RNA的纯化和回收的核酸产品。该试剂盒基于表面修饰的磁珠能够与核酸特异结合的原理,采用高性能磁珠和独特缓冲液体系,可有效去除反应体系中盐离子及有机杂质等。试剂盒使用操作简便、流程快速,所得RNA完整性好、纯度高。 产品特点 · 简便:简便快速的操作流程,获得高纯度RNA; · 高效...