Illumina测序原理是基于NGS(下一代测序技术),也被称为第二代测序技术。这种技术相比第一代测序技术具有更高的测序通量。 具体到RNA-Seq(转录组测序),其测序原理如下: 1.样本准备:首先,需要从研究样本中提取总RNA。 2.建库:将RNA样本进行反转录,生成cDNA。然后,通过PCR扩增,将cDNA片段固定在测序芯片上。 3.测序...
高通量测序（High-throughput sequencing），也被称为第二代测序技术，是一种可以对DNA或RNA进行快速测序的技术。相比于传统的第一代测序技术，高通量测序能够在更短的时间内，同时测序更多的DNA或RNA样本。高通量测序的主要原理是将DNA或RNA分子随机断裂成大量小片段，并在流式细胞仪上进行高通量并行的测序。具体步骤...
RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...
因为II代测序(NGS)的illumina测序不能测很长的seq,约为200-700bp,所以不能测得mRNA全长,因此需要进一步把合成的cDNA利用酶打断到illumina能测的长度(长度有些随机,比如300bp的cDNA能通过头尾150bp完整测序,但700bp的cDNA只能通过头尾150bp测序+参考基因组推断出来)。然后在cDNA的3'端插入Truseq Read2引物(和Trus...
RNA测序(RNA Sequencing,简称RNA-Seq,也被称为全转录物组鸟枪法测序Whole Transcriptome Shotgun Sequencing,简称WTSS),是基于二代测序技术研究转录组学的方法,可以快速获取给定时刻的一个基因组中RNA的种类和数量。 RNA-Seq有助于查看基因的不同转录本、转录后修饰、基因融合、突变/SNP和基因表达随时间的变化,或在...
转录组测序RNA-Seq是基于二代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集,然后反转录为 cDNA后进行的高通量测序,在此基础上进行片段的拼接组装,从而可得到一个个的转录本,进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行...
随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(spatialomics)也在积极研究中。通过结合新兴的三代长读长long-read和direct RNA-seq技术,以及更好的计算...
Ion AmpliSeq™ 转录组人基因表达试剂盒与微阵列技术相比,具有更大的定量线性动态范围,在利用新一代测序 (NGS) 提高速度和灵敏度的同时,保持简单的样品制备和数据分析。只需加入 10 ng RNA 并采用与福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 兼容的样品制备方式、测序和数据分析工作流程,即可靶向检测 >20,000个RefSeq 转录...
RNA-Seq,即RNA测序又称转录组测序,是基于第二代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA,然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序,在此基础上进行片段的重叠组装,从而可得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解(globle)。进一步说,若和下一阶段的...