以确定剪接的确切位置;DII和III是两个较小的结构域,对组装活性内含子结构和激活剪接反应方面起着关键作用,其中DIII还可作为“催化效应器”来加速催化反应;DIV是一个茎环(stem-loop)结构,其loop序列上包含maturase(成熟酶)的ORF,靠近其5’端的亚结构域DIVa含有一个对I...
以确定剪接的确切位置;DII和III是两个较小的结构域,对组装活性内含子结构和激活剪接反应方面起着关键作用,其中DIII还可作为“催化效应器”来加速催化反应;DIV是一个茎环(stem-loop)结构,其loop序列上包含maturase(成熟酶)的ORF,靠近其5’端的亚结构域DIVa含有一个对IEP具有高亲和力结合位点(图6B)。
在这篇文章中,研究人员研发出了一种具有某种配体亲和性,能识别RNA结构和序列作用的整体策略,并将其应用于茎-环结合蛋白(stem-loop–binding protein,SLBP,生物通译),从中获得了理想的结果。 这种技术的全称为RNA分子互作机械诱导捕获技术(RNA–mechanically induced trapping of molecular interactions ,RNA-MITOMI,生物...
以上结合方式促使gRNA形成“发卡状” (“hairpin-like”) 结构,可以保护其末端免于核酸酶降解,同时gRNA的“锚定”区 (“anchor” region) 和“引导”区 (guiding region) 形成了RNA茎环 (stem-loop) 结构,阻止了gRNA与mRNA的结合(图1)。 图1. RESC-A结合gRNA并将其稳定于闭合状态 2. gRNA如何定义mRNA编辑...
帽结合蛋白(cap-binding proteins)与帽识别,从而促进翻译 Transport of mRNAs out of nucleus转运mRNA到核外 U1 snRNA由聚合酶II转录,加帽,迁移到细胞质。U6 snRNA由聚合酶III转录,不加帽,留在核内。如果将U6 snRNA基因连接在U1 snRNA启动子后,使它由聚合...
Hairpin：发夹，当然是一条链的。一般会有个主干（stem）和一个环（loop）。做RNAi的人经常碰到，主要...
ceRNA 不是指一个分子, 而是 RNA 与 RNA 之间多元调控的一种交互模型。一个 miRNA 结合的靶基因可能有上百个, 而 mRNA 的 3'UTR 和大量的非编码 RNA 上, 也有远远不止一个的 miRNA 识别元件, miRNA recognition elements(MRE), 或者叫 miRNA binding sites, miRNA 结合位点。
其中RNA pulldown 是检测 RNA 结合蛋白与其靶 RNA 相互作用的主要技术之一,是近年来研究 lncRNA 、 circRNA 与蛋白质相互作用的主要手段。 1、RNA pulldown 原理与应用 1.1 RNA pulldown 的技术原理 RNA pulldown 技术为研究 RNA 和蛋白质相互作用的核心技术,该技术利用生物素标记的 RNA 和链霉亲和素标记的磁珠...
An example of an RNA stem-loop. If now a second RNA stem-loop has complementary base-sequence, the two loops can base pair resulting in a kissing loop. 假结(pseudoknot) 假结(pseudoknot)是包含至少两个茎环结构的核酸二级结构,其中一个茎的一半插入在另一个茎的两半之间。 1982 年,在萝卜黄花叶...
Analysis of TAF15-RRM solution structure and its binding with stem-loop RNA has yielded conclusive evidence of a non-canonical mode of RNA recognition. Rather than classical stacking interactions that occur across nitrogen bases and aromatic amino acids on ribonucleoprotein sites, moderate-affinity ...