以确定剪接的确切位置;DII和III是两个较小的结构域,对组装活性内含子结构和激活剪接反应方面起着关键作用,其中DIII还可作为“催化效应器”来加速催化反应;DIV是一个茎环(stem-loop)结构,其loop序列上包含maturase(成熟酶)的ORF,靠近其5’端的亚结构域DIVa含有一个对IEP具有高亲和力结合位点(图6B)。
该SRA茎环相互作用RNA结合蛋白(SLIRP)抗体(SRA stem-loop interacting RNA binding protein (SLIRP) antibody)产品的背景资料详情,请查看Covalab提供的产品说明书。 其他 Covalab位于法国,自1995年公司成立以来,在抗体开发和生产方面拥有卓越的经验。Covalab提供超过15000种产品,包括抗体和试剂盒。拥有多种针对流行和罕见靶...
以上结合方式促使gRNA形成“发卡状”(“hairpin-like”)结构,可以保护其末端免于核酸酶降解,同时gRNA的“锚定”区 (“anchor” region) 和“引导”区 (guiding region) 形成了RNA茎环 (stem-loop) 结构,阻止了gRNA与mRNA的结合(图1)。 图1....
常见的RNA模体结构包括:假节、吻式发夹、四环、核糖拉链 等(Common motifs include the pseudoknot, kissing hairpin, tetraloops, and ribose zippers) kissing loop An example of an RNA stem-loop. If now a second RNA stem-loop has complementary base-sequence, the two loops can base pair resulting in...
因此,常常形成stem-loop ( 茎环) 结构,然后Cas6作为一种特异的RNA 内切酶将会识别并且结合在repeat 序列的stem-loop 区域,同时,在stem-loop结构的3´ 端之后进行剪切,从而产生成熟的crRNA。crRNA 的5´ 端和3´ 端为repeat 序列,中间为spacer序列, ...
一个 miRNA 结合的靶基因可能有上百个, 而 mRNA 的 3'UTR 和大量的非编码 RNA 上, 也有远远不止一个的 miRNA 识别元件, miRNA recognition elements(MRE), 或者叫 miRNA binding sites, miRNA 结合位点。 miRNA 结合靶基因被证明是依赖于 RISC 蛋白复合体的, RISC 复合体中有个关键催化组分蛋白叫 AGO2...
In this review, an RNA-binding peptide has been defined as a contiguous peptide chain of ≤30 amino acids that is unfolded or only weakly structured in the absence of RNA and yet binds RNA in a sequence-specific manner. From: Current Opinion in Structural Biology, 2000 ...
研究表明,拟南芥ASCO-lncRNA竞争NUCLEAR SPECKLE RNA- binding proteins (NSRs)并且隔绝NSRs以调节靶基因的选择性剪接模式(图4d)(Bardou et al. 2014)。lncRNA也是端粒酶分子机制的组成部分。例如,lncRNA AtTR是端粒酶的RNA亚基,它与端粒酶逆转录酶(TELOMERASE REVERSE TRANSCRIPTASE, TERT)相互作用,维持端粒的完整性...
另一类是找到与感兴趣的蛋白结合的RNA,如RIP、CLIP等。其中RNApulldown是检测RNA结合蛋白与其靶RNA相互作用的主要技术之一,是近年来研究lncRNA、circRNA与蛋白质相互作用的主要手段。 1.RNApulldown原理与应用 1.1 RNApulldown的技术原理: RNA pulldown技术为研究RNA和蛋白质相互作用的核心技术,该技术利用生物素标记的...
Second, a 20 nucleotide sequence of RNase P RNA called the RNA loop sequence (RP-loop) is fused to the 5′ terminal end of a guide RNA sequence to create a hybrid gRNA. The RP loop was previously shown to translocate non-mitochondrial RNA to the mitochondrial inner membrane by binding ...