J. M.; Florens, L.; Washburn, M. P.; Van Nostrand, E. L.; Pratt, G. A.; Schwinn, M. K.; Daniels, D. L.; Yeo, G. W., SONAR Discovers RNA-Binding Proteins from Analysis of Large-Scale Protein-Protein Interactomes. Molecular cell 2016, 64 (2)...
(2)Parsley T B, Towner J S, Blyn L B, et al. Poly (rC) bindingprotein2 forms a ternary complex with the 5′-terminal sequences of poliovirus RNA and the viral 3CD proteinase[J]. Rna, 1997, 3(10): 1124-1134. (3)Zhao J, Ohsumi T K, Kung J T, et al. Genome-wideidentificat...
RBPs,RNA结合蛋白(RNA-binding proteins)是一类伴随RNA的调控代谢过程、与RNA结合的蛋白质的总称,它在转录后基因表达调节中起着重要的作用,主要是依赖其与RNA相互作用来调节细胞的功能。目前发现人类的RBPs共有2000多个,其中占蛋白质编码基因的7.5%。RBPs是一类高度保守的蛋白,...
答案是肯定的,即RNA免疫共沉淀(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RIP)技术。 在原理上,RIP与ChIP非常相似,可以理解为只是研究对象不同,RIP主要是研究蛋白-RNA间的互作情况。这些RNA可以是mRNA、非编码RNA甚至病毒RNA等。在实验方案和步骤上,RIP也有自身特别需要注意的地方,后面将会一一介绍。 RIP实验可根据目的分...
“我们相信这一类技术会大幅拓宽小分子调控 RNA 的可能性,从简单的小分子结合 RNA(binding)演变成小分子修饰 RNA(modifying)。”童玉铨表示。 (来源:Nature) 另据悉,童玉铨是安徽合肥人。从合肥一中毕业之后,他来到美国伊利诺伊大学厄巴那香槟分校读本科,期间学习化学工程专业。
precisely mapping the binding sites of RNA-binding proteins, and also ensures that bona fide cross-linked [...] labome.com 这种在被测序的cDNA序列中的转变提供了一个巧妙的解决 准 确 绘 制 RNA 结 合 蛋白 的结 合位点方法,从而从噪声中获得了真实的交联的RNA序列。 labome.cn Antagomirs ...
核酸结合域的类型,因为我们是进行RNA-蛋白预测,选RNA-binding only即可。 计算是局限于一组特定的结合域或扩展到无序区域,(建议选择No)。 同时,你也可以选择分析转录组中非编码部分还是编码部分,针对lncRNA而言,我们选择Noncoding,如果是mRNA,则选择Coding ...
2) RNA binding motif RNA结合motif 1. The deduced protein, which was named as RNA binding motif protein 13 (RBM13), shows 41 % identity to MAK16 protein of S. 该编码蛋白有一个双侧核定位信号motif和一个RNA结合motif,将这一新cDNA序列推导的蛋白命名为RNA结合基序蛋白 13 (RBM 13) ,基因定...
RNA结合蛋白(RNA Binding Protein):简称"RBP",是一类伴随RNA的调控代谢过程,与RNA结合的蛋白质的总称。RBP伴随RNA生命始终,可以不夸张的说:没有RBP,RNA寸步难行。其主要作用是介导RNA的成熟、转运、定位和翻译;一个RBP可能存在多种靶标RNA;且其表达缺陷会造成多种疾病。 搜索发现 广告 〖推荐〗单机大型游戏_...
4、DeepBind:a tool for predicting the sequence specificities of DNA- and RNA-binding proteins by deep learning. 预测工具,可通过深度学习预测DNA和RNA结合蛋白的特征序列。使用者在物种目录下选择特定的Protein,输入或者上传RNA的序列,预测结果展示查询的RNA序列与选定Protein之间结合的序列特异性。