研究这些假设蛋白质的功能可能具有重要意义,但它们的详细功能应该在未来得到解决。 图2 采用RNA-seq筛选多糖利用位点(PULs) 3.卵形拟杆菌(Bacteroides ovatus)产生的A23-1降解产物可能不支持益生菌的生长 在添加或不添加碳源的条件下,分析了BO和益生菌在MCB培养基中的生长情况。结果显示,在添加5mg/mL葡萄糖的条件下...
通过无机化学方法、体外细胞实验和多种研究方法(包括MTT,免疫荧光,透射电镜,RNA-seq,流式细胞术,RT-qPCR等),揭示了Ir1诱导肿瘤铁死亡的分子机制。体内动物实验(小鼠皮下成瘤)验证了Ir1肿瘤的抑制效果。 结果: 研究发现Ir1定位在溶酶体上,催化类芬顿反应诱导铁死亡,改变细胞超微结构并显著影响与铁死亡和肿瘤免疫相关...
本文揭示了二茂铁铱(III)二磷酸络合物Ir1在二茂铁基团的作用下可催化类芬顿反应生成•OH和LPO,从而诱导肿瘤细胞发生铁死亡的分子机制。RNA-seq结果和小鼠体内实验表明,Ir1可以显著影响与铁死亡和肿瘤免疫相关的通路,启动强烈的免疫反应,从而诱导免疫原性细胞死亡,有效抑制原发和远处肿瘤生长。 参考文献 Wen-Jin Wang, ...
第一篇文章是2015年发表在BMC Genomics上的文章,作者对RNA-Seq数据进行了常规的分析,包括对样本测序深度、测序数据质量统计,比对reads在鸡参考基因组上的分布情况,幼鸡和产蛋鸡表达量最多的前十种基因,可变剪接情况,以及GO和KEGG富集情况统计及分析。最终通过RNA-Seq分析,探讨了幼年和产蛋鸡肝脏表达谱的差异情况,分析...
通过RNAseq可以筛选出差异表达的分子,进而选取分子进行验证,构建调控机制。但可能整个实验的周期很长,比如1-2年时间,甚至更长。通过接触很多的客户,发现许多老师,在我们这里做了RNAseq实验,希望先对RNAseq的数据进行分析,整理,希望纯数据分析或者稍加验证就可以发表文章,虽然这类文章看过很多,但没有总结明确的规律,...
RNAseq，即通过高通量测序技术进行转录组测序分析技术，作为研究RNA的表达水平以及表达差异基因的应用，在过去的十几年内迅速发展。而今，RNAseq在转录本变异检测，基因融合检测，可变剪切检测等场景均有大规模的应用。转录本变异检测，是指通过比较样本RNA序列和参考基因组对应序列，来寻找单碱基多态性和小片段的插入缺失...
RNAseq,即通过高通量测序技术进行转录组测序分析技术,作为研究RNA的表达水平以及表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今,RNAseq在转录本变异检测,基因融合检测,可变剪切检测等场景均有大规模的应用。转录本变异检测,是指通过比较样本RNA序列和参考基因组对应序列,来寻找单碱基多态性和小片段的插入缺失,其结...
文章:用单细胞RNA-Seq的测序技术研究了肺部表皮发育相关的内容 肺癌的分类 小细胞肺癌 非小细胞肺癌 其中非小细胞肺癌绝大部分是由环境因素和一些突变mutation造成的;小细胞肺癌大部分是由于自身的遗传因素造成的,包括吸烟导致的肺癌都是非小细胞肺癌。目前重点研究领域在非小细胞肺癌。
伯豪技术服务:RNA-seq 导语 牛膝是治疗骨质疏松症的著名中药。多糖是形成肠道微生物群的主要因素,是双棱草的主要成分。然而,双歧杆菌多糖对人体肠道菌群的生物活性尚不清楚。本文从苦参中提取并纯化了平均分子量为93.085 kDa的果胶多糖A23-1。A23-1由鼠李糖、葡萄糖醛酸、半乳糖醛酸、葡萄糖、半乳糖和阿拉伯糖组成...
基于db/db小鼠RNA-seq结果分析,T2DM引发的心肌损伤有关与铁死亡有关。最后结合RDH10-cKO小鼠和铁死亡抑制剂(ferrostatin-1,Fer-1)/高铁喂养(high iron diet,HID)设计分组,证实RDH10调控铁死亡相关蛋白。 研究结论 RDH10减少是心脏视黄醇代谢异常的起因,并通过脂毒性和铁死亡导致DCM。