在RNA-seq文库中，一些转录本可能有高的重复率，因为它们在样本中表达水平高。高表达的基因的重复率很高...
除了分析基因表达水平,RNA-Seq还能发现新的转录本、SNP、剪接变体,并提供等位基因特异的基因表达。 RNA-Seq的动态范围更广,且假阳性可能更小,这意味着RNA-Seq的数据重复性应当比芯片要高。RNA-Seq能够检测样品中的所有RNA,这对于鉴定细胞的新颖转录本来说是个优点,但同时缺点在于,它检测了总的RNA,而细胞中很大一...
这也是当下RNA-Seq研究的主体[55]。 3.4遗传机制揭示 利用RNA-Seq测序技术可对物种进行亲缘关系分析、遗传多样性与居群遗传结构检测、遗传作图、基因定位、分子标记辅助育种等方面的研究。Zhang等[42]利用Illumina Hiseq 2000获得了龙胆根和叶转录组的序列和转录丰度数据。...
标准的RNA seq分析是利用大量组织或者细胞进行的,不能保存空间三维信息和细胞类型,不利于我们理解生物的复杂性。为了能深入研究,大佬们提出了超RNA分析技术,如单细胞测序和空间转录组等。 单细胞测序 scRNA-seq以单个细胞为样本(使用流式细胞仪,需要分离细胞,操作难度大),然后标记扩增其RNA,过程与常规转录组测序相似。
m6A RNA甲基化文库构建试剂盒(测序版)【MeRIP测序试剂盒】基于CUT&RUN技术开发。非常适合从广泛的物种比如从哺乳类动物,植物,真菌和细菌,不仅如此,还包括培养细胞与新鲜和 冷冻的组织等感兴趣的样本中提取总RNA来富集片段化的含有m6A的RNA。整个实验时间不到6小时。手动操作不到1小时。
RNA测序(RNA-seq)是转录组学研究的重要工具,也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性,转录组学有以下优势:1)能够动态考察细胞基因组的表达,多维度地反映差异变化;2)可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA,研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用;3)与蛋白组学研究相互补充...
RNA-Seq可进行全基因组水平的基因表达差异研究,具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点。除了分析基因表达水平,RNA-Seq还能发现新的转录本、SNP、剪接变体,并提供等位基因特异的基因表达。对于RNA-Seq的优缺点,Helicos BioSciences的研究人员在《PloS ONE》上做了清晰阐述。
转录组测序技术（RNA-seq）作为目前二代测序领域最普遍的技术手段而获得广泛应用，应运而生的多种方法各有特点、争奇斗艳。传统方法通常需要富集mRAN，片段化mRNA，反转录和加接头，及扩增等。缺点是只能每个样品独立建库，获得的全长转录组信息中绝大多信息在后期分析中极少用到，普遍存在建库步骤多、...