A workflow for RNA-seq Ruairi J, Genomics Research, 2018 我们的优势 1.八年转录组测序分析经验,自主研发了多个生物学领域内认可的软件,如差异可变剪接算法ASD、CASH等,检出率和准确度超过同类软件; 2. 不依赖已有物种信息,可研究非模式物种,针对不同平台的数据,制定多套流程; 3. 整合了众多学术界公认的转录...
推荐测序产品 Ion AmpliSeq 转录组解决方案 Ion Proton 系统 Ion GeneStudio S5 系列测序仪采用Ion Torrent NGS 技术进行的RNA测序 从靶向基因表达分析到全转录组测序,Ion Torrent™ 产品将简单的样品制备与直观的数据分析相结合,最终实现完整的 RNA 测序方案。靶向...
Aksomics(原康成生物)基于高通量测序平台,为您提供一站式RNA测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,Aksomics的技术服务人员就可为您完成全部实验操作,包括RNA抽提、rRNA去除、文库构建、高通量测序和数据分析、并提供完整的实验报告。 服务 单细胞组学 生物分子凝聚体研究 DNA/RNA/蛋白相互作用 R-loop研...
NadPrep®Total RNA-To-DNA Module搭配 NadPrep®DNA 通用型文库构建试剂盒(for MGI)建库,捕获 Panel 为 NanOnco Plus Panel v2.0 ,分别进行:直接测序(Total RNA-Seq),去除 rRNA 测序(rRNA-depleted RNA-Seq)和捕获后测序(RNAcap-Seq)。A.比较不同方法下 K562 细胞系和 FFPE 组织来源 rRNA 的占比,RNA...
DNBelab C系列高通量单细胞RNA-Seq DNBelab C系列平台基于液滴微流控策略,可以实现高效细胞捕获,完成高效的mRNA反转录和扩增后,结合华大DNBSEQ™高通量测序平台和Dr. Tom单细胞全交互式数据挖掘交付系统,进行高性价比单细胞转录组文库测序和数据分析挖掘,可广泛应用于研究免疫细胞、肿瘤微环境、神经系统发育及胚胎发育...
scGRO-seq推断组蛋白基因的细胞周期 目前,用于确定的细胞周期状态的传统scRNA-seq方法存在一定局限性,首先是大多数scRNA-seq依赖于poly(A)尾进行捕获测序,因此无法检测到复制依赖性组蛋白基因(在S期专门转录的最佳细胞周期期特异性基因,无poly(A)尾);其次,这些基因高度特异表达于S期,在前期样本制备时可能存在一定滞后...
在NCBI Short Read Archive (SRA)数据共享平台中多于95%的数据来自于Illumina short-read测序技术(表2)。目前几乎所有已发布的mRNA-seq数据都是short-read测序所得,所以我们认为这是RNA-seq技术的常规操作,接下来讨论它的主要流程和限制。不过在转录异构体检测的研究(图一;表1)方面,不断进步的long-read cDNA测序...
在全长转录组基础之上,ONT-三代测序平台的直接RNA测序(Direct RNA-seq),相对于传统的反转录cDNA - PCR扩增(二代和三代RNA-seq测序都有相应的建库方案)流程,其能够保留并检测天然RNA碱基修饰信息,还原真实RNA特征,也省去了传统 RNA m6A甲基化修饰繁琐的实验检测步骤, 如 MeRIP-seq/m6A-seq和m6A-SEAL-seq等 。
RNA-Seq测序,又称RNA sequence测序,即转录组测序,简称RNA测序,就是用高通量测序技术进行测序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。 什么是转录组? 转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生...