转录组测序(RNA-Seq,RNA sequencing)是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物(包括mRNA、非编码RNA等)进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络,是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
转录组测序(RNA-seq)就是利用高通量测序技术将细胞或组织中全部或部分mRNA、small RNA和no-codingRNA进行测序分析的技术。RNA-seq既可以提供定量分析,检测基因表达水平差异,又可以提供结构分析,能发现稀有转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合等,而且不依赖于参考基因组。 目前,转录组测序已经是开展分子生物学研究...
转录组测序RNA-Seq是基于二代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集,然后反转录为 cDNA后进行的高通量测序,在此基础上进行片段的拼接组装,从而可得到一个个的转录本,进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行...
RNA-Seq 的的发展前景 1、虽然RNA-Seq 技术还面临着种种困难, 但作为一个刚刚起步的新技术RNA-Seq 已经显示出其他转录组学技术无可比拟的优势:既能提供单碱基分辨率的转录组注释又能提供全基因组范围的“数字化”的基因表达谱, 而且其成本通常比芯片和大规模的Sanger EST 测序要低, 有 2、就目前来看, 作为...
百度试题 题目 RNA-seq又称( ) A.转录组高通量测序B.转录组学C.全转录组鸟枪法测序D.芯片杂交平台 相关知识点: 试题来源: 解析 A,C 反馈 收藏
RNA-seq数据通常具有很高的重复率,许多读数映射到转录组的同一位置。 在全基因组测序中,重复读数代表PCR失误而被删除。而转录组测序中,重复代表真实的生物信号被保留。后者需注意只有一对片段的一段必须相同,才能确定其为重复序列。 UMIs:独特分子识别符,在文库制备过程中添加的短序列,其直接与RNA连接。
在过去的十年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在全转录组范围内分析差异基因表达和mRNAs差异剪接的重要工具。然而,随着下一代测序技术的发展,RNA-seq技术也在不断发展。现在,RNA-seq用于研究RNA生物学的许多方面,其中包括单细胞基因表达、翻译(翻译组,translatome)和RNA结构(结构组,structurome)。RNA-seq的其它应用也在...
转录组测序(RNA-Seq)的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。新一代高通量测序技术能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。
目前随着二代测序技术的迅猛发展,其高通量、快速、低成本的特点成为越来越多的生物学研究者在解决生物学问题时的首选,尤其在转录组测序方面更显示出极大的潜力。 应用领域 RNA-Seq技术可以解决新基因的深度发掘、低丰度转录本的发现、转录图谱绘制、可变剪接的调控、代谢途径确定、基因家族鉴定及进化分析等各方面的问题...