了解复杂的人类疾病需要整合多种组学技术的数据,例如基因组学、转录组学、表观基因组学和蛋白质组学。下一代测序(NGS) 用于各种应用,例如检查 DNA 序列(全基因组测序 (WGS)、全外显子组测序 (WES))、研究 DNA 和组蛋白修饰(ChIP-Seq、Mmethyl-Seq、ATAC -Seq)和RNA测序,目前商业测序技术由Illumina主导。WGS...
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性：高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计，例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外，该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合，如ChIP-seq、甲基化测序等，从而进一步扩展了其应用范围。
全基因组关联分析( 是对多个个体在全基因组范围的遗传变异(标记)多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型与可观测的性状,即表型,进行群体水平的统计学分析,根据统计量或显著性 p 值筛选出最有可能影响该性状的遗传变异(标记),挖掘与性状变异相关的基因。
增强子是在发育和疾病过程中对基因调控和细胞识别控制至关重要的远端基因组元件,增强子在转录过程中会转录表达非编码增强子RNA(eRNA),越来越多的研究表明eRNA在基因调控中发挥重要作用,而且eRNA对细胞类型和状态具有高度特异性,可以通过研究eRNA转录表达而将其作为诊断标志物或治疗靶点,因此研究增强子对于解析细胞周期、发育...
另外作为RNA精准编辑工具，LEAPER不会引起基因组序列改变，在安全性方面具有优势。尽管LEAPER在科研和疾病...
基于小鼠15个组织RNA-seq数据的全基因组重注释 一、研究背景 近年来,RNA-seq技术在分子生物学中得到广泛应用。通过RNA-seq技术可以快速获得高通量的转录组数据,对基因功能以及转录调节进行研究,有助于深入了解生物的基本生理和病理过程。在进行RNA-seq实验时,进行正确的注释是基础,它能够影响到结果的准确性和可靠性。
汪亚平研究员为共同通讯作者在《Immun Ageing》杂志发表了题为“Genome-wide DNA methylation reveals potential epigenetic mechanism of age-dependent viral susceptibility in grass carp”的研究论文,该研究通过全基因组DNA甲基化测序(WGBS)和对应的转录组测序(RNA-seq),并通过BSP和qPCR验证,揭示了草鱼年龄依赖病毒易...
涉及主要技术:WGS(二代+三代)、Hi-C、全长RNA-seq、广靶代谢组等 1.黄芩T2T无间隙基因组的测序和组装 基因组调查显示,黄芩的基因组大小约为356.29 Mb,杂合率为1.08%。结合不同测序平台,作者对黄芩进行T2T无间隙基因组组装。作者获得了37.04 Gb Pacbio HiFi reads, 23.51 Gb ONT超长reads和35.17 Gb Hi-C ...
该团队开发了scGRO-seq:一种使用点击化学(Click chemistry)的新型单细胞新生RNA测序技术,可在单细胞水平上揭示全基因组的协调转录。scGRO-seq证明了转录的偶发性,并通过直接定量单个细胞中的转录RNA聚合酶来估计爆发大小和频率。 既往研究已经记录了增强子如何转录成增强子RNA或eRNA。科学家们怀疑这种转录是在增强子与其...
RNA测序(RNA-Seq)和甲基化测序在多个方面存在显著差异,具体如下: 研究对象:RNA-Seq主要关注RNA分子,包括mRNA、非编码RNA和小RNA等,而甲基化测序则专注于DNA的甲基化状态,特别是胞嘧啶的甲基化。 测序目的:RNA-Seq旨在了解转录组在不同条件下的表达情况,包括基因的表达水平、转录本的变异、转录后修饰等。而甲基化...