RIP、RNA pull-down和MeRIP等实验技术是我们深入研究RNA和蛋白质相互作用的关键工具。RIP用于选择性地富集与特定RNA相互作用的蛋白质,RNA pull-down通过RNA探针捕获相互作用蛋白质,而MeRIP则用于甲基化RNA的研究。下面就让我们详细了解一下—— RIP RIP,全称为RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白...
除RIP和RNA pull Down以外,凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA),也称为凝胶阻滞实验或DNA结合实验,是一种广泛应用于分子生物学的研究技术,也可以用于研究蛋白质(尤其是转录因子)与DNA或RNA之间的相互作用。基本原理 EMSA的基本原理是利用凝胶电泳技术来观察蛋白质与DNA或RNA形成...
RNA Pull-down和RNA免疫沉淀(RNA Immunoprecipitation, RIP)是研究RNA和蛋白互作的主流技术。RNA Pull-down更倾向于通过目标RNA(已知的RNA)去找到相互作用的未知蛋白,而RIP技术则更多应用于通过目标蛋白(已知蛋白)去找到相互作用的未知RNA。技术原理 RNA Pull-down用于研究RNA与蛋白质之间的相互作用。这项技术在...
RIP-seq实验流程 RNA pull-down RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA pull-down使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot实验...
随后利用RNA Pull-Down技术鉴定与ELENA1结合的中介体亚基,结果显示MED19a与MED26b均能在体外与ELENA1 RNA结合,同时利用elf18处理MED19a/MED26b敲除株,发现只有MED19a敲除株中PR1表达情况显示出与ELENA1敲除株系相似的趋势。进一步利用GFP标记法、TriFC、RIP实验证明中介体亚基MED19a与ELENA1在体内也存在相互作用。以上...
随后利用RNA Pull-Down技术鉴定与ELENA1结合的中介体亚基,结果显示MED19a与MED26b均能在体外与ELENA1 RNA结合,同时利用elf18处理MED19a/MED26b敲除株,发现只有MED19a敲除株中PR1表达情况显示出与ELENA1敲除株系相似的趋势。进一步利用GFP标记法、TriFC、RIP实验证明中介体亚基MED19a与ELENA1在体内也存在相互作用。以上...
【文献阅读】| 读图 | RIP、ChIP、CoIP、RNA pull down到底是些啥?| 大分子间相互作用(一) 6585 3 33:22 App RIP试剂盒实验操作步骤 1.6万 62 58:18 App GST pull-down检测技术及应用研究 4324 1 3:00:07 App Pull-down+Co-IP+IP-MS大合集(11.19日下午培训) 6426 6 10:36 App GST pull do...
(三)云序客户利用RIP和RNApull down技术发表环状RNA机制文章解析 云序客户文章1:探究环状RNA的海绵机制 发表期刊:Cancer Gene Therapy 影响因子:4.681 实验方法:RIP-PCR、RNA pull down-PCR 实验对象:前列腺癌细胞 文献网址:https://sci-hub.shop/10.1038/s41417-019-0085-y ...
要想进行深层次的挖掘,可以研究其作用机制,RNA pull down、RIP、双荧光素酶等实验技术,检测与目标RNA相互作用的蛋白质或RNA,进一步揭示RNA的生物学功能。然后在动物或细胞模型中验证RNA的功能和调控机制,进一步确认其在生理和病理条件下的重要性。图2 LncRNA研究思路 深入了解LncRNA作用机制能够帮助我们识别疾病的...
RIP,RNA 结合蛋白便宜共沉淀,是从蛋白出发研究蛋白RNA相互作用的技术。就是已知一个蛋白,推测会与你的目的RNA相互作用,用蛋白的抗体做免疫共沉淀,把蛋白结合的RNA富集出来并鉴定目的RNA,以证实蛋白与RNA的相互作用。 RNA pulldown是从RNA出发研究蛋白与RNA相互作用的技术。就是用已知的RNA 去拉蛋白,在做western验证...