RIP、RNA pull-down和MeRIP等实验技术是我们深入研究RNA和蛋白质相互作用的关键工具。RIP用于选择性地富集与特定RNA相互作用的蛋白质,RNA pull-down通过RNA探针捕获相互作用蛋白质,而MeRIP则用于甲基化RNA的研究。下面就让我们详细了解一下—— RIP RIP,全称为RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白...
【文献阅读】| 读图 | RIP、ChIP、CoIP、RNA pull down到底是些啥?| 大分子间相互作用(一) 6585 3 33:22 App RIP试剂盒实验操作步骤 1.6万 62 58:18 App GST pull-down检测技术及应用研究 4324 1 3:00:07 App Pull-down+Co-IP+IP-MS大合集(11.19日下午培训) 6426 6 10:36 App GST pull do...
RNA Pull-down和RNA免疫沉淀（RNA Immunoprecipitation， RIP）是研究RNA和蛋白互作的主流技术。RNA Pull-down更倾向于通过目标RNA（已知的RNA）去找到相互作用的未知蛋白，而RIP技术则更多应用于通过目标蛋白（已知蛋白）去找到相互作用的未知RNA。技术原理 RNA Pull-down用于研究RNA与蛋白质之间的相互作用。这项技术在...
1)利用AGO2-RIP-PCR(云序提供该服务)证明,AGO2能够富集circINTS4和miR-146b(图B);2)通过双荧光素酶报告实验证明circINTS4与miR-146b存在结合位点(图C、D);3)作者通过circINTS4探针进行pull down PCR(云序提供该服务)实验,证明circINTS4 能够拉下miR-146b(图E)。 云序客户文章2:探究农口当中环状RNA的海...
除RIP和RNA pull Down以外，凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA)，也称为凝胶阻滞实验或DNA结合实验，是一种广泛应用于分子生物学的研究技术，也可以用于研究蛋白质（尤其是转录因子）与DNA或RNA之间的相互作用。基本原理 EMSA的基本原理是利用凝胶电泳技术来观察蛋白质与DNA或RNA形成...
(一)RNA-pulldown RNA-pulldown 实验可以在体外样品中通过高亲和性的标签(例如生物素,biotin),选择性地获取蛋白-RNA复合物。RNA探针可以是生物素化标记的,和细胞裂解液或者重组蛋白孵育后,通过strepavidin agarose 或者磁珠进行分离。分离后获得的蛋白可以通过western blot 或者质谱(mass spectrometry)来进行分析。这是...
随后利用RNA Pull-Down技术鉴定与ELENA1结合的中介体亚基,结果显示MED19a与MED26b均能在体外与ELENA1 RNA结合,同时利用elf18处理MED19a/MED26b敲除株,发现只有MED19a敲除株中PR1表达情况显示出与ELENA1敲除株系相似的趋势。进一步利用GFP标记法、TriFC、RIP实验证明中介体亚基MED19a与ELENA1在体内也存在相互作用。以上...
近年来,以长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)为中心连同miRNA被发现具有广泛的生物学功能,逐渐成为生物医学领域的研究热点,而RIP-seq与RNA pull down是非编码RNA与蛋白研究中最常用到的两种分子互作技术。小编将逐一对这两种技术进行介绍。
RIP,RNA 结合蛋白便宜共沉淀,是从蛋白出发研究蛋白RNA相互作用的技术。就是已知一个蛋白,推测会与你的目的RNA相互作用,用蛋白的抗体做免疫共沉淀,把蛋白结合的RNA富集出来并鉴定目的RNA,以证实蛋白与RNA的相互作用。 RNA pulldown是从RNA出发研究蛋白与RNA相互作用的技术。就是用已知的RNA 去拉蛋白,在做western验证...
RNA pull-down RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA pull-down使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot实验检测特定的RNA结合蛋白...