总的来说,RNA-BisSeq不需要在细胞中表达外源基因或化学试剂,能够准确捕获细胞和组织中原始的m5C修饰状态。RNA-BisSeq被广泛用于探索各种RNA中m5C的表达特征,并预测其潜在功能,包括哺乳动物、斑马鱼、拟南芥和水稻。RNA-BisSeq中m5C检测的准确性取决于亚硫酸盐处理过程中C到U的转化效率,这受到反应条件(如温度、反应时...
RNA-BisSeq被广泛用于探索各种RNA中m5C的表达特征,并预测其潜在功能,包括哺乳动物、斑马鱼、拟南芥和水稻。RNA-BisSeq中m5C检测的准确性取决于亚硫酸盐处理过程中C到U的转化效率,这受到反应条件(如温度、反应时间)和RNA状态(如RNA质量、RNA二级结构等)的影响(表2)。m6A-SEAL-seq FTO辅助的m6A选择性化学标记测序(m...
总的来说,RNA-BisSeq不需要在细胞中表达外源基因或化学试剂,能够准确捕获细胞和组织中原始的m5C修饰状态。RNA-BisSeq被广泛用于探索各种RNA中m5C的表达特征,并预测其潜在功能,包括哺乳动物、斑马鱼、拟南芥和水稻。RNA-BisSeq中m5C检测的准确性取决于亚硫酸盐处理过程中C到U的转化效率,这受到反应条件(如温度、反应时...
在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚硫酸盐处理,将mRNA中未发生甲基化的胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U),进行反转录后形成cDNA;文库制备完成后,通过高通量测序分析,可得m5C 修饰的位点,从而满足您对...
与m6A一样,mRNAs上的m5C在RNA稳定、翻译和核转运方面发挥着关键性作用。近年来的研究表明,YBX1是人类除ALYREF以外的另一种m5C“读出因子”蛋白,可通过结合m5C位点提高mRNA的稳定性。一份使用多聚体分析和RNA-BisSeq的最新报告显示,m5C甲基化水平与核糖体结合呈...
免疫荧光染色和GO分析揭示NSUN2在卵巢癌细胞中的定位和肿瘤相关调控通路。此外,通过RNA-BisSeq、RNA-seq、RIP-seq和ChIP-seq等技术分析了NSUN2介导的基因表达调控,并验证E2F1在NSUN2介导的卵巢癌进展中发挥至关重要的作用。 研究结果 (1)NSUN2在卵巢癌组织中过表达,NSUN2过表达与卵巢癌症患者预后不良相关...
易基因研究团队早在2009年,Nucleic Acids Research发表第一篇亚硫酸盐RNA甲基化m5C检测方案后,就已跟对方合作开展其在高通量测序上的应用,技术可算得上放心!在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚...
易基因研究团队早在2009年,Nucleic Acids Research发表第一篇亚硫酸盐RNA甲基化m5C检测方案后,就已跟对方合作开展其在高通量测序上的应用,技术可算得上放心!在此基础上,我们重磅推出m5C RNA甲基化测序科研服务产品——RNA-BisSeq: 检测原理与DNA的5mC修饰类似, RNA甲基化修饰m5C的检测方法也是通过对样品进行重亚...
NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行RNA-BisSeq。经过生信分析,发现在HEK293细胞有12442个m5C位点,在NSUN2-/-HEK293细胞中有3270个m5C位点,在注释mRNA中分别有1142...
研究通过RNA-Bis-seq等分析鉴定出m5C甲基转移酶NSUN2在CRC中表达水平升高及其在CRC中的致癌作用，以及...