由于细胞间相互作用是抗肿瘤疗效的关键因素,研究注释了T 细胞亚型和巨噬细胞,使用单细胞RNA-seq 数据集进行细胞通讯分析R-loop 评分与恶性细胞(如CXCL16 和 CXCL2)的趋化因子水平显著呈正相关(图3A),高R-loop评分明显促进了恶性细胞产生的共刺激分子,包括TNFSF12、ICAM1和TNFRSF14(图3B),同时,R-loop高分细胞...
此外,两种药物在8个R-loop功能位点上表现出相同的药物敏感性特征,涉及的基因包括锌指转录因子、肿瘤抑制因子及其同源物、Wnt信号通路相关基因、E3泛素连接酶等,暗示着维持或强化它们的正常功能可能是增强肿瘤细胞对治疗药物敏感性的关键途...
在R-loop评分较低的样本中,导致肿瘤进展的能量代谢途径显着丰富(图6中/右)。因此,能量代谢和R-loop评分之间的联系可能解释了恶性细胞的耐药状态。 图6 在更多数据集和癌种中验证R-loop评分 文章进一步评估了R-loop对预后的影响,绘制了与R-loop评分相关的风险比(HR)曲线,发现R-loop评分在7个独立的LUAD队列中...
在R-loop评分较低的样本中,导致肿瘤进展的能量代谢途径显着丰富(图6中/右)。因此,能量代谢和R-loop评分之间的联系可能解释了恶性细胞的耐药状态。 图6 在更多数据集和癌种中验证R-loop评分 文章进一步评估了R-loop对预后的影响,绘制了与R-loop评分相关的风险比(HR)曲线,发现R-loop评分在7个独立的LUAD队列中...
这是由于Rag1敲除鼠没有适应性免疫系统,这强调了杀手T细胞在ARID1A突变肿瘤的抗肿瘤免疫反应中的重要地位。针对肿瘤细胞或肿瘤浸润T细胞的RNA测序和单细胞 RNA 测序进一步描绘了ARID1A 缺失对肿瘤-免疫微环境(TME)的影响。ARID1A敲除B16F10 肿瘤表现出抗原呈递基因以及免疫原性趋化因子的上调。为了在单细胞分辨率下...
为进一步了解R-loop是否可以影响控制肿瘤进展的关键因素:免疫逃逸,文章通过单细胞测序分析表明,R-loop低分细胞有肿瘤相关抗原(TAA)和主要组织相容性(MHC)分子的表达下调,免疫抑制因子表达上调(图2A)。利用GSEA分析文章发现R-loop低分组的免疫原性细胞死亡通路显著下调,功能失调的CD4+和CD8+ T细胞、耗竭NK细胞比例显著升...
本研究提供了新发现的 R-loop 结合蛋白与结直肠癌发生的关联,以及它们在塑造染色体不稳定性和肿瘤微环境中的综合作用。更重要的是,该项研究表明了这些蛋白在诊断和治疗策略中的应用前景。结直肠癌分子亚型的确定对于结直肠癌的诊疗至关重要,有助于为结直肠癌患者提供更佳的治疗选择,从而改善患者的临床获益。
在一项研究中,ARID1A缺失会引起R-Loop的急剧增加,进而诱发抗肿瘤免疫反应。而在另一项研究中,DHX9的功能丧失则被认为是炎症性肠病(IBD)患者中R-Loop积累的原因,进而导致基因组的不稳和细胞功能的损害。在这个过程中,我们看到R-Loop引起的转录-复制冲突,会使得基因的表达和复制受到影响,进而导致DNA损伤,从而可能...
这些数据表明,ARID1A 缺失的癌细胞中 STING 对于增加肿瘤中免疫细胞的招募、增强 T 细胞功能和减缓肿瘤生长表型是必需的,而一些 ARID1A 突变癌症可通过下调 STING 作为免疫逃逸机制。 为了测试该研究在临床相关治疗干预的背景下的影响,研究...
而内源性RNA导致的DNA损伤(染色体易位)是驱动白血病的肿瘤发生和疾病侵袭性的体内证据。这代表了一种以前未知的、基于基因组失衡的肿瘤发生机制,其普遍性可能更加广泛,可能对更广泛地了解基因组突变至关重要,并可作为治疗的一个新靶标。 教科书或将重写:革命性研究发现体内癌症发生的新原因...