由于细胞间相互作用是抗肿瘤疗效的关键因素,研究注释了T 细胞亚型和巨噬细胞,使用单细胞RNA-seq 数据集进行细胞通讯分析R-loop 评分与恶性细胞(如CXCL16 和 CXCL2)的趋化因子水平显著呈正相关(图3A),高R-loop评分明显促进了恶性细胞产生的共刺激分子,包括TNFSF12、ICAM1和TNFRSF14(图3B),同时,R-loop高分细胞...
RBM15的敲除显著降低了R-loop水平和m6A修饰,而过表达则有相反效果,强调了RBM15在R-loop m6A甲基化中的关键作用。 03 ▼ 总结 本文揭示了R-loops在前列腺癌发展中的重要作用,特别是IGF2BPs蛋白通过识别m6A修饰的R-loops来调控基因表...
基于R-loop靶向编辑技术,首次系统检测了R-loop位点对肿瘤药物敏感性的影响,鉴定出肿瘤细胞对药物敏感相关的R-loop位点,这些位点的鉴定为进一步了解肿瘤细胞耐药性机理提供了研究方向。在此基础上,可以深入探索R-loop变化对基因调控区域的...
这些数据表明ARID1a 缺失的肿瘤细胞的趋化因子表达可能会吸引 T 细胞进入肿瘤，其中 T 细胞来源的 IFNγ 进一步诱导已准备好的肿瘤细胞抗原呈递复合物，从而增加 T 细胞的杀伤。因为有研究表明ARID1A 的缺失与 R-loop 的积累相关，研究人员调查了源自细胞核内R-loop 的细胞质内ssDNA导致的病毒拟态，而已知这种ssDNA...
全面分析了R-loop在肿瘤免疫微环境(TME)中的分布模式,强调了异常R-loop在癌症发展中的因果作用。 揭示了R-loop评分模式下代谢重编程和T细胞衰竭的潜在分子机制。 为低评分R-loop分布下免疫逃逸和代谢重编程介导的药物耐受机制提供了新的思路。 方法与结论 ...
本研究提供了新发现的 R-loop 结合蛋白与结直肠癌发生的关联,以及它们在塑造染色体不稳定性和肿瘤微环境中的综合作用。更重要的是,该项研究表明了这些蛋白在诊断和治疗策略中的应用前景。结直肠癌分子亚型的确定对于结直肠癌的诊疗至关重要,有助于为结直肠癌患者提供更佳的治疗选择,从而改善患者的临床获益。
存在证据表明,复制叉可以通过RNA-DNA杂合片段的解旋由复制复合体解开,或者通过在R-loop下游重新启动复制来绕过R-loop。 如上所述,复制叉与R-loop的同向碰撞减少了R-loop水平,可能是因为CMG复合体的解旋酶MCM可以解开领先链上的RNA-DNA杂合片段。PrimPol通过在GAA重复序列处促进复制叉的进展来帮助复制叉通过R-loop;...
全面分析了R-loop在肿瘤免疫微环境(TME)中的分布模式,强调了异常R-loop在癌症发展中的因果作用。 揭示了R-loop评分模式下代谢重编程和T细胞衰竭的潜在分子机制。 为低评分R-loop分布下免疫逃逸和代谢重编程介导的药物耐受机制提供了新的思路。 方法与结论 ...
由R-loop导致的基因组不稳定和复制压力是癌前和癌细胞的标志,是潜在的癌症驱动因子。许多研究表明,R-loop频率、稳定性或基因组位置的改变与癌症状态相关,例如原癌基因激活和抑癌基因失活。癌细胞存在于肿瘤微环境(TME),微环境中还有成纤维细胞、内皮细胞、上皮细胞和髓样细胞等,调控着肿瘤的进展和对治疗的反应。
在一项研究中,ARID1A缺失会引起R-Loop的急剧增加,进而诱发抗肿瘤免疫反应。而在另一项研究中,DHX9的功能丧失则被认为是炎症性肠病(IBD)患者中R-Loop积累的原因,进而导致基因组的不稳和细胞功能的损害。在这个过程中,我们看到R-Loop引起的转录-复制冲突,会使得基因的表达和复制受到影响,进而导致DNA损伤,从而可能...