由于细胞间相互作用是抗肿瘤疗效的关键因素,研究注释了T 细胞亚型和巨噬细胞,使用单细胞RNA-seq 数据集进行细胞通讯分析R-loop 评分与恶性细胞(如CXCL16 和 CXCL2)的趋化因子水平显著呈正相关(图3A),高R-loop评分明显促进了恶性细胞产生的共刺激分子,包括TNFSF12、ICAM1和TNFRSF14(图3B),同时,R-loop高分细胞...
此外,两种药物在8个R-loop功能位点上表现出相同的药物敏感性特征,涉及的基因包括锌指转录因子、肿瘤抑制因子及其同源物、Wnt信号通路相关基因、E3泛素连接酶等,暗示着维持或强化它们的正常功能可能是增强肿瘤细胞对治疗药物敏感性的关键途...
这些数据表明ARID1a 缺失的肿瘤细胞的趋化因子表达可能会吸引 T 细胞进入肿瘤，其中 T 细胞来源的 IFNγ 进一步诱导已准备好的肿瘤细胞抗原呈递复合物，从而增加 T 细胞的杀伤。因为有研究表明ARID1A 的缺失与 R-loop 的积累相关，研究人员调查了源自细胞核内R-loop 的细胞质内ssDNA导致的病毒拟态，而已知这种ssDNA...
RBM15的敲除显著降低了R-loop水平和m6A修饰,而过表达则有相反效果,强调了RBM15在R-loop m6A甲基化中的关键作用。 03 ▼ 总结 本文揭示了R-loops在前列腺癌发展中的重要作用,特别是IGF2BPs蛋白通过识别m6A修饰的R-loops来调控基因表...
全面分析了R-loop在肿瘤免疫微环境(TME)中的分布模式,强调了异常R-loop在癌症发展中的因果作用。 揭示了R-loop评分模式下代谢重编程和T细胞衰竭的潜在分子机制。 为低评分R-loop分布下免疫逃逸和代谢重编程介导的药物耐受机制提供了新的思路。 方法与结论 ...
由R-loop导致的基因组不稳定和复制压力是癌前和癌细胞的标志,是潜在的癌症驱动因子。许多研究表明,R-loop频率、稳定性或基因组位置的改变与癌症状态相关,例如原癌基因激活和抑癌基因失活。癌细胞存在于肿瘤微环境(TME),微环境中还有成纤维细胞、内皮细胞、上皮细胞和髓样细胞等,调控着肿瘤的进展和对治疗的反应。
全面分析了R-loop在肿瘤免疫微环境(TME)中的分布模式,强调了异常R-loop在癌症发展中的因果作用。 揭示了R-loop评分模式下代谢重编程和T细胞衰竭的潜在分子机制。 为低评分R-loop分布下免疫逃逸和代谢重编程介导的药物耐受机制提供了新的思路。 方法与结论 ...
本研究提供了新发现的 R-loop 结合蛋白与结直肠癌发生的关联,以及它们在塑造染色体不稳定性和肿瘤微环境中的综合作用。更重要的是,该项研究表明了这些蛋白在诊断和治疗策略中的应用前景。结直肠癌分子亚型的确定对于结直肠癌的诊疗至关重要,有助于为结直肠癌患者提供更佳的治疗选择,从而改善患者的临床获益。
生活中,我们可能并未意识到,有很多研究已经证实R-Loop与多种疾病尤其是癌症以及神经系统疾病的发生密切相关。在一项研究中,ARID1A缺失会引起R-Loop的急剧增加,进而诱发抗肿瘤免疫反应。而在另一项研究中,DHX9的功能丧失则被认为是炎症性肠病(IBD)患者中R-Loop积累的原因,进而导致基因组的不稳和细胞功能的损害。在...
图1 circR-loop在与白血病和染色体不稳定相关的基因内富集 circMLL形成R-loop的量化和可视化以及诱发转录暂停 为了评估MLL重组体下circR-loop导致染色体易位的可行性,作者在HEK293T细胞中过表达完全包含在MLL中的circRNAs(circMLL(9,10)和circMLL(12))及其共同伴侣基因MLLT1(circMLLT1(2)),并进行了DRIP-seq(特异...